Table 3 List of shared frameshift mutations and stop codons
From: Gene loss and genome rearrangement in the plastids of five Hemiparasites in the family Orobanchaceae
Gene | Species | Amino Acid | SC or FS |
|---|---|---|---|
ndhA | B. americana | 19 | SC |
S. hermonthica | 20 | SC | |
S. aspera | 20 | SC | |
ndhB | S. hermonthica | 24 | FS |
S. aspera | 24 | FS | |
S. hermonthica | 118 | SC + FS | |
S. aspera | 118 | SC + FS | |
ndhD | S. hermonthica | 94 | FS |
S. aspera | 94 | FS | |
S. hermonthica | 116 | FS | |
S. aspera | 116 | FS | |
S. hermonthica | 152 | FS | |
S. aspera | 152 | FS | |
S. forbessii | 269 | FS | |
S. hermonthica | 269 | FS | |
S. aspera | 269 | FS | |
S. hermonthica | 319 | FS | |
S. aspera | 317 | FS | |
S. hermonthica | 358 | FS | |
S. aspera | 356 | FS | |
S. hermonthica | 372 | FS | |
S. aspera | 370 | FS | |
S. hermonthica | 391 | FS | |
S. aspera | 389 | FS | |
S. hermonthica | 425 | FS | |
S. aspera | 424 | FS | |
ndhF | S. hermonthica | 3 | SC |
S. aspera | 3 | SC | |
S. forbessii | 20 | SC | |
S. hermonthica | 20 | SC | |
S. aspera | 20 | SC | |
S. hermonthica | 81 | FS | |
S. aspera | 91 | FS | |
S. forbessii | 617 | FS | |
S. aspera | 593 | FS | |
ndhI | B. americana | 90 | SC |
S. forbessii | 89 | SC | |
S. hermonthica | 90 | SC | |
S. aspera | 90 | SC | |
S. hermonthica | 112 | FS | |
S. aspera | 112 | FS | |
ndhK | S. hermonthica | 3 | FS |
S. aspera | 3 | FS | |
accD | B. americana | 57 | FS |
S. forbessii | 12 | FS | |
S. hermonthica | 12 | FS | |
S. aspera | 59 | FS | |
B. americana | 92 | FS | |
S. forbessii | 47 | FS | |
S. hermonthica | 47 | FS | |
S. aspera | 129 | FS | |
ycf1 | B. americana | 251 | FS |
S. forbessii | 256 | FS | |
S. hermonthica | 258 | FS | |
S. aspera | 254 | FS | |
B. americana | 360 | FS | |
S. forbessii | 386 | FS | |
S. hermonthica | 392 | FS | |
S. aspera | 391 | FS | |
S. forbessii | 467 | FS | |
S. hermonthica | 491 | FS | |
S. aspera | 475 | FS | |
B. americana | 674 | FS | |
S. forbessii | 648 | FS | |
S. hermonthica | 661 | FS | |
S. aspera | 660 | FS | |
S. hermonthica | 1288 | FS | |
S. aspera | 1287 | FS | |
S. hermonthica | 1452 | SC | |
S. aspera | 1451 | SC | |
S. hermonthica | 1462 | FS | |
S. aspera | 1461 | FS | |
ycf2 | S. hermonthica | 482 | FS |
S. aspera | 489 | FS | |
B. americana | 848 | FS | |
S. forbessii | 1024 | FS | |
S. hermonthica | 987 | FS | |
S. aspera | 994 | FS |