Table 3 Primers designed to perform qPCR experiments with the shortlisted nine miRNAs
miRNA | Stem loop primer | Forward primer |
|---|---|---|
osa-miR169 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC GAATGG | GTGGGCATCATCCATCCTA |
ppt-miR1223 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC TAGAGG | GGGGTTGTAGAGTCATGCA |
aly-miR398 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC CATATG | GTTGGGGTCGACATGAGAA |
gra-miR482 | GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACTTGGAA | AACACGCTTCCCAAAACCTC |
gma-miR4415 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC CCATGT | GTTTGGGTTGATTCTCATCACA |
mtr-miR5261 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC AGCCAA | GGGGTCATTGTAGATGGCT |
ath-miR167 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC CCAGAT | GTTTGAAGCTGCCAGCATG |
ath-miR1886 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC TTTTCT | GGGGGTGAGAAGAAGAAGA |
mtr-miR164 | GTTGGCTCTGGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACCAGAGCCAAC TGCACG | GTTTTGGAGAAGCAGGGCA |
Reverse common | GTCGTATCCAGTGCAGGGT |