From: Genome-wide association mapping for root traits in a panel of rice accessions from Vietnam
QTLs | Chr | Position | Nb ass. | LLGHT | TIL | DEPTH | MRL | NCR | NR_T | THK | DW0020 | DW2040 | DW4060 | DWB60 | DRW | RDW | SDW | PDW | SRP | DRP | R_S |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
A. Whole panel | |||||||||||||||||||||
q33 | 1 | 146 251 | 3 | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â |
q83 | 1 | 2 173 691 | 2 | Â | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â |
q66 | 2 | 5 015 093 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |
q8 | 3 | 27 657 195 | 2 | Â | * | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q67 | 6 | 4 021 017 | 4 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | (*) | Â | (*) | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |
q24 | 6 | 4 127 010 | 5 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | (*) | ** | Â | * | * | Â | Â | Â | Â | Â |
q76 | 6 | 14 008 461 | 6 | Â | Â | Â | Â | ** | Â | Â | * | Â | Â | * | (*) | * | Â | (*) | Â | Â | Â |
q79 | 6 | 16 912 708 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â | * | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |
q15 | 7 | 18 507 925 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â | * | * | Â | Â | Â |
q16 | 8 | 27 413 965 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | (*) | Â | Â | Â |
q43 | 11 | 5 272 788 | 2 | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q45 | 11 | 8 972 097 | 9 | Â | (*) | Â | Â | *** | Â | Â | * | * | Â | Â | (*) | * | (*) | * | Â | Â | * |
q31 | 11 | 22 579 249 | 2 | Â | Â | ** | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q32 | 12 | 7 681 309 | 2 | Â | Â | ** | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
B. Indica subpanel | |||||||||||||||||||||
q73 | 1 | 5 851 606 | 3 | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | ** | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q84 | 1 | 6 404 307 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | * | Â |
q65 | 4 | 30 438 406 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â |
q69 | 6 | 4 127 010 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â | * | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |
q41 | 6 | 14 126 219 | 3 | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |
q68 | 6 | 17 005 559 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | (*) | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q82 | 6 | 21 716 314 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | * | Â |
q3 | 8 | 4 413 495 | 2 | * | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q45 | 11 | 8 972 097 | 6 | Â | Â | Â | Â | ** | Â | Â | (*) | (*) | Â | Â | (*) | * | Â | (*) | Â | Â | Â |
C. Japonicasubpanel | |||||||||||||||||||||
q72 | 1 | 2 678 840 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | (*) | Â |
q48 | 1 | 2 710 978 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q40 | 5 | 7 422 947 | 2 | Â | (*) | Â | Â | * | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
q70 | 10 | 11 589 746 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | * | Â | * | (*) | Â | Â | Â | Â | Â |