Table 3 FindMiRNA predictions matching known microRNAs
Prediction ID | Vvi-miRBase mature vs FindMiRNA mature | Vvi-miRBase mature vs FindMiRNA targets | Vvi-miRBase precursors vs IASMA genome | all miRBase mature vs FindMiRNA precursors |
|---|---|---|---|---|
464982 | Vvi-miR156 | Vvi-miR156 | Vvi-miR156 | miR156 |
116355 | Vvi-miR159 | Vvi-miR159 | miR159 | |
116356 | Vvi-miR159 | Vvi-miR159 | miR159 | |
126771 | Vvi-miR159 | miR319 | ||
29160 | Vvi-miR160 | Vvi-miR160 | Vvi-miR160 | miR160 |
304077 | ||||
486346 | ||||
43452 | Vvi-miR160 | miR160 | ||
317194 | ||||
496248 | ||||
496249 | ||||
25252 | Vvi-miR164 | |||
680841 | ||||
37580 | Vvi-miR164 | miR164 | ||
399187 | Vvi-miR171 | Vvi-miR171 | miR171 | |
412275 | Vvi-miR171 | miR171 | ||
412283 | ||||
412284 | ||||
412286 | ||||
412287 | ||||
368753 | Vvi-miR171 | miR171 | ||
399184 | ||||
378732 | Vvi-miR171 | miR171 | ||
4592 | Vvi-miR172 | Vvi-miR172 | miR172 | |
729515 | ||||
729516 | ||||
256855 | Vvi-miR172 | Vvi-miR172 | Vvi-miR172 | miR172 |
256857 | ||||
256858 | ||||
256859 | ||||
256856 | Vvi-miR172 | Vvi-miR172 | miR172 | |
729517 | Vvi-miR172 | miR172 | ||
567062 | Vvi-miR319 | miR319 | ||
567063 | ||||
567065 | ||||
21821 | Vvi-miR393 | Vvi-miR393 | Vvi-miR393 | miR393 |
534183 | ||||
749266 | Vvi-miR395 | |||
749267 | ||||
749268 | Vvi-miR395 | Vvi-miR395 | miR395 | |
749269 | ||||
760872 | miR395 | |||
760873 | ||||
760874 | ||||
760875 | ||||
51691 | Vvi-miR396 | |||
353241 | Vvi-miR396 | miR396 | ||
279806 | Vvi-miR397 | Vvi-miR397 | Vvi-miR397 | miR397 |
315332 | miR397 | |||
575210 | Vvi-miR399 | Vvi-miR399 | miR399 | |
575211 | ||||
584266 | miR399 | |||
157143 | miR403 | |||
290554 | Vvi-miR403 | miR403 | ||
290555 | ||||
765421 | Vvi-miR414 | |||
93427 | Vvi-miR477 | |||
274857 | ||||
752076 | ||||
752079 | ||||
752084 | ||||
560409 | Vvi-miR479 | |||
50626 | Vvi-miR535 | |||
220937 | Vvi-miR828 | miR828 | ||
628384 | Vvi-miR828 | Vvi-miR828 | miR828 |