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Table 1 Carotenoid metabolism gene name, ID, and sequence information

From: Comparative metabolomic and transcriptomic analysis reveals a coexpression network of the carotenoid metabolism pathway in the panicle of Setaria italica

Gene

E.C.

NCBI ID

Xiaomi ID

yugu1 ID

isoelectric point

molecule weight

PSORT

protein length

SiDXS1

2.2.1.7

101,752,673

Si3g23880

Seita.3G245500

6.8

77,109.14

cyto

717

SiDXS2

2.2.1.7

101,761,672

Si2g07510

Seita.2G068200

6.85

76,986.96

mito

721

SiDXS3

2.2.1.7

101,755,270

Si4g03680

Seita.4G031100

6.01

78,989.42

chlo

721

SiDXR

1.1.1.267

101,779,357

Si5g07910

Seita.5G071800

6.44

51,245

cysk

472

SiMCT

2.7.7.60

101,776,634

Si5g40650

Seita.5G407200

8.2

32,333.52

chlo

297

SiCMK

2.7.1.148

101,762,054

Si5g35430

Seita.5G351100

6.04

43,879.51

chlo

404

SiMDS

4.6.1.12

101,757,872

Si1g27830

Seita.1G272600

9.52

65,443.67

nucl

605

SiHDS

1.17.7.1

101,757,740

Si1g23200

Seita.1G223900

5.63

82,255.08

cyto

746

SiHDR

1.17.7.4

101,779,322

Si9g10620

Seita.9G105600

5.64

51,719.51

chlo

466

SiIDI1

5.3.3.2

101,776,451

Si3g23600

Seita.3G241900

5.94

32,873.71

chlo

297

SiIDI2

5.3.3.2

101,757,504

Si2g34540

Seita.2G344000

6.28

37,523.76

mito

334

SiIDI3

5.3.3.2

101,757,120

Si2g34530

Seita.2G343900

5.19

26,535.25

cyto

233

SiGGPPS7a

2.5.1.1

101,763,054

Si2g36780

Seita.2G368100

6.18

38,272.95

mito

359

SiGGPPS7b

2.5.1.1

101,781,099

Si5g07040

Seita.5G062900

6.46

37,432.52

chlo

365

SiGGPPS7c

2.5.1.1

101,773,288

Si1g27280

Seita.1G266500

6.15

35,656.98

chlo

340

SiAACT1

2.3.1.9

101,762,107

Si7g28520

Seita.7G280000

6.02

41,059.23

chlo

401

SiAACT2

2.3.1.9

101,752,713

Si5g08110

Seita.5G074000

8.11

43,122.41

chlo

421

SiAACT3

2.3.1.9

101,771,647

Si5g31350

Seita.5G308600

5.83

41,231.32

chlo

401

SiHMGS1

2.3.3.10

101,757,046

Si9g54750

Seita.9G564900

6.1

70,931.78

nucl

649

SiHMGS2

2.3.3.10

101,761,667

Si6g23300

Seita.6G234800

6.11

48,769.71

nucl

436

SiHMGS3

2.3.3.10

101,778,463

Si2g28300

Seita.2G279400

5.82

52,344.33

nucl

470

SiHMGR1

1.1.1.34

101,777,901

Si1g31130

Seita.1G294900

9.02

56,290.87

plas

540

SiHMGR2

1.1.1.34

101,754,923

Si6g20840

Seita.6G208200

7.94

60,576.86

E.R.

574

SiHMGR3

1.1.1.34

101,777,103

Si2g26210

Seita.2G257000

8.35

62,101.51

E.R.

584

SiMVK

2.7.1.36

101,779,972

Si3g26580

Seita.3G273700

5.42

40,498.61

plas

387

SiMVK-like

2.7.1.36

101,761,036

Si2g35580

Seita.2G354500

5.34

40,499.55

cyto

387

SipMVKp

2.7.4.2

101,757,567

Si9g45700

Seita.9G467300

6.19

54,814.23

cyto

512

SiMDC1

4.1.1.33

101,783,413

Si1g35390

Seita.1G351000

5.96

46,029.43

chlo

420

SiMDC2

4.1.1.33

101,785,083

Si3g38700

Seita.3G395300

6.03

46,365.95

cyto

423

SiPSY1

2.5.1.32

101,786,849

Si4g27520

Seita.4G288600

8.97

46,899.94

chlo

415

SiPSY2

2.5.1.32

101,756,152

Si2g30580

Seita.2G303000

9.04

48,655.63

chlo

440

SiPSY3

2.5.1.32

101,759,707

Si3g38930

Seita.3G397800

8.78

45,494.92

chlo

409

SiPDS

1.3.5.5

101,771,481

Si9g50120

Seita.9G515900

8.38

69,490.07

chlo

619

SiZDS

1.3.5.6

101,786,776

Si2g08440

Seita.2G077800

7.98

63,378.75

chlo

575

SiZ-ISO

5.2.1.12

101,783,502

Si3g30280

Seita.3G304800

9.3

40,735.41

chlo

373

SiCRTISO

5.2.1.13

101,781,301

Si8g16170

Seita.8G158400

6.3

64,075.75

chlo

592

SiLYCE

5.5.1.18

101,764,899

Si5g21910

Seita.5G258300

6.24

50,077.69

cyto

442

SiLYCB

5.5.1.19

101,763,950

Si1g06300

Seita.1G055200

7.18

53,665.03

chlo

495

SiCYP97C1

1.14.14.158

101,758,095

Si9g33310

Seita.9G336100

5.92

65,129.85

chlo

583

SiCYP97A3

1.14.-.-

101,780,326

Si1g36810

Seita.1G367300

5.88

70,177.46

chlo

645

SiBCH1

1.14.15.24

101,770,294

Si9g54300

Seita.9G559200

9.12

33,335.42

chlo

309

SiBCH2

1.14.15.24

101,757,118

Si7g21990

Seita.7G209000

9.83

33,887.3

chlo

311

SiZEP1

1.14.15.21

101,781,949

Si7g13140

Seita.7G116800

7.16

69,731.49

mito

635

SiZEP2

1.14.15.21

101,780,465

Si7g13100

Seita.7G116400

8.82

82,101.33

chlo

751

SiVDE

1.23.5.1

101,754,003

Si7g08440

Seita.7G067200

5.32

51,047.11

chlo

450

SiNCED1a

1.13.11.51

101,783,411

Si1g31780

Seita.1G288400

6.33

70,862.24

chlo

659

SiNCED1b

1.13.11.51

101,778,945

Si9g15380

Seita.9G156500

6.08

65,918.88

chlo

607

SiNCED4

1.13.11.51

101,766,978

Si2g04470

Seita.2G035400

6.3

62,697.22

chlo

582

SiNCED5

1.13.11.51

101,770,668

Si3g38270

Seita.3G391000

6.56

70,850.96

chlo

659

SiCCD7

1.13.11.68

101,764,126

Si7g20330

Seita.7G189300

8.9

67,763.96

chlo

619

SiCCD8a

1.13.11.69

101,774,274

Si8g10360

Seita.8G101900

7.91

59,808.24

chlo

542

SiCCD8b

1.13.11.69

101,767,759

Si5g32040

Seita.5G315800

6.48

62,634.96

chlo

577

SiCCD8c

1.13.11.69

101,763,948

Si5g32020

Seita.5G315600

6.04

61,291.42

chlo

560

SiCCD8d

1.13.11.69

101,767,361

Si5g32030

Seita.5G315700

7.66

60,585.91

chlo

553