Skip to main content

Table 3 Genome-wide Association Mapping results of beneficial mineral elements (P < 10–5)

From: Identification of novel genomic regions associated with nine mineral elements in Chinese winter wheat grain

Trait

Env

SNP marker

Chr.

Position

P

R2 (%)

Ca

E4

Excalibur_c41752_392

3B

67

4.70E-05

8.92

E4

BS00057451_51

3B

67

4.70E-05

8.92

E4

Kukri_c41797_393

5A

53

7.13E-06

10.97

E4

RFL_Contig2187_1025

5A

53

7.13E-06

10.97

Mn

E2

wsnp_Ex_c4561_8184576

1B

75

6.26E-05

8.33

E2

wsnp_BF478690B_Ta_2_1

1B

75

6.72E-05

8.28

E2

Excalibur_c5218_75

1B

75

7.28E-05

8.2

E2

IAAV2125

1B

75

6.72E-05

8.28

E2

IAAV6731

1B

75

6.72E-05

8.28

E2

JD_c3116_778

1B

75

6.26E-05

8.33

E2

Ra_c37969_549

1B

75

8.25E-05

8.05

E2

RAC875_c19014_725

1B

75

6.26E-05

8.33

E2

RAC875_rep_c112555_200

1B

75

6.72E-05

8.28

E2

RAC875_rep_c119728_146

1B

75

8.92E-05

7.97

E2

TA003725-0553

1B

75

8.92E-05

7.97

E2

BS00022619_51

1B

75

7.72E-05

8.14

E2

BS00022920_51

1B

75

6.72E-05

8.28

E2

Tdurum_contig81102_102

1B

75

8.92E-05

7.97

Fe

E2

wsnp_Ex_c11913_19105189

5A

16

5.47E-05

8.75

E2

RAC875_rep_c112368_118

5A

16

7.57E-05

8.77

E2

Excalibur_c6326_77

6B

20

1.46E-05

10.19

E2

RAC875_s114363_172

6B

22

5.14E-05

8.87

E3

wsnp_Ex_c65899_64135487

7D

26

8.79E-05

8.12

E3

wsnp_Ra_c8297_14095831

7D

26

9.09E-05

8.07

E3

D_contig11494_202

7D

26

7.70E-05

8.25

E3

D_F5XZDLF01ASSE2_190

7D

26

7.70E-05

8.25

E3

Ex_c25027_535

7D

26

7.70E-05

8.25

E3

Excalibur_c833_1405

7D

26

8.85E-05

8.1

E3

Kukri_rep_c103404_314

7D

26

7.70E-05

8.25

E3

BS00022449_51

7D

26

7.82E-05

8.25

E3

BS00110124_51

7D

27

7.70E-05

8.25

E3

BS00110642_51

7D

27

7.70E-05

8.25

E3

D_GB5Y7FA02IDDA9_183

7D

30

7.70E-05

8.25

E3

TA005377-1076

7D

32

6.50E-05

8.43

E4

Excalibur_c19455_3496

7B

163

8.12E-08

16.23

E4

Excalibur_c11062_582

7B

171

1.44E-05

10.26

E4

Excalibur_c25090_830

7B

171

2.81E-06

12.07

E4

RAC875_rep_c110526_229

7B

171

1.44E-05

10.26

Cu

E2

Excalibur_c29255_366

4B

104

8.12E-05

8.91

Zn

E1

BS00012036_51

2B

108

8.49E-05

8

E1

BS00062691_51

4B

62

7.05E-06

12.12

E1

CAP8_rep_c6942_227

7A

148

8.98E-05

7.94

E1

BS00072941_51

7B

71

2.42E-05

9.29

E1

BobWhite_c7907_657

7B

71

2.42E-05

9.29

E1

Kukri_c78330_327

7B

71

3.23E-05

8.99

E1

RFL_Contig2540_306

7B

71

2.42E-05

9.29

E1

TA003961-0636

7B

71

2.42E-05

9.29

E1

BS00095819_51

7B

72

6.62E-05

8.25

E1

Tdurum_contig75931_1967

7B

72

6.62E-05

8.25

E1

BobWhite_c40042_842

7B

101

8.98E-05

7.94

E3

Ra_c19225_591

2B

130

4.19E-05

8.19

E3

wsnp_Ex_c9428_15641609

7A

159

3.63E-05

8.42

E3

wsnp_Ex_c9428_15641639

7A

159

1.91E-05

8.98

E4

Excalibur_c41752_392

3B

67

7.87E-07

13.25

E4

BS00057451_51

3B

67

7.87E-07

13.25

Se

E1

Excalibur_rep_c93332_58

3D

107

1.07E-05

10.06

E1

BobWhite_c9622_723

3D

113

3.93E-05

8.99

E1

wsnp_Ku_c21275_31007309

5A

83

3.46E-05

8.77

E2

Tdurum_contig4974_355

4B

61

8.65E-05

8.7

E2

wsnp_Ex_c14654_22713386

7A

42

2.66E-05

9.68

E2

D_contig06359_118

7D

56

2.80E-05

9.52

  1. E1, E2, E3 and E4 were same as the Table 1