Table 2 Duplication analysis of the AP2/ERF gene family
Sequence 1 | Sequence2 | Ka | Ks | Ka_Ks | Effective Len | Average S-sites | Average N-sites |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
RcERF021 | RcERF042 | 0.29553678 | 1.72567726 | 0.1712584 | 582 | 132 | 450 |
RcERF012 | RcERF057 | 0.40300562 | 1.38085301 | 0.2918527 | 924 | 212.75 | 711.25 |
RcERF048 | RcERF075 | 0.4114621 | NaN | NaN | 900 | 197.4166667 | 702.5833333 |
RcERF051 | RcERF076 | 0.33331089 | 2.56556843 | 0.129917 | 1209 | 275.3333333 | 933.6666667 |
RcERF046 | RcERF081 | 0.3163392 | 1.85921206 | 0.1701469 | 609 | 153.4166667 | 455.5833333 |
RcERF025 | RcERF088 | 0.57783254 | 1.78941311 | 0.3229174 | 708 | 160.9166667 | 547.0833333 |
RcERF064 | RcERF092 | 0.35723109 | NaN | NaN | 699 | 158 | 541 |
RcERF063 | RcERF093 | 0.36996467 | 1.47353077 | 0.2510736 | 432 | 104.4166667 | 327.5833333 |
RcERF070 | RcERF098 | 0.6685266 | 1.81097809 | 0.3691522 | 753 | 174 | 579 |
RcERF021 | RcERF100 | 0.38250295 | 1.50870683 | 0.2535303 | 612 | 138.9166667 | 473.0833333 |
RcERF040 | RcERF101 | 0.27568714 | NaN | NaN | 561 | 126.0833333 | 434.9166667 |
RcERF022 | RcERF103 | 0.41399228 | 1.28764002 | 0.3215124 | 735 | 178.9166667 | 556.0833333 |
RcERF031 | RcERF104 | 0.27070983 | 1.29444056 | 0.2091327 | 429 | 104.0833333 | 324.9166667 |
RcERF032 | RcERF105 | 0.27018563 | 1.27442854 | 0.2120053 | 1797 | 397.1666667 | 1399.833333 |
RcERF074 | RcERF107 | 0.76307193 | NaN | NaN | 969 | 216.1666667 | 752.8333333 |
RcERF072 | RcERF109 | 0.57052476 | 1.55144847 | 0.3677368 | 684 | 155.4166667 | 528.5833333 |
RcERF009 | RcERF112 | 0.56506363 | 2.56420719 | 0.2203658 | 852 | 194.25 | 657.75 |
RcERF020 | RcERF112 | 0.48408323 | NaN | NaN | 972 | 229.5 | 742.5 |
RcERF019 | RcERF119 | 0.62960209 | 2.53219954 | 0.2486384 | 666 | 161.75 | 504.25 |
RcERF003 | RcERF123 | 0.5452034 | 2.76643897 | 0.1970777 | 759 | 188.8333333 | 570.1666667 |
RcERF034 | RcERF131 | 0.34870274 | 1.21479419 | 0.2870468 | 1011 | 238.8333333 | 772.1666667 |