Skip to main content

Table 2 Duplication analysis of the AP2/ERF gene family

From: Global analysis of the AP2/ERF gene family in rose (Rosa chinensis) genome unveils the role of RcERF099 in Botrytis resistance

Sequence 1 Sequence2 Ka Ks Ka_Ks Effective Len Average S-sites Average N-sites
RcERF021 RcERF042 0.29553678 1.72567726 0.1712584 582 132 450
RcERF012 RcERF057 0.40300562 1.38085301 0.2918527 924 212.75 711.25
RcERF048 RcERF075 0.4114621 NaN NaN 900 197.4166667 702.5833333
RcERF051 RcERF076 0.33331089 2.56556843 0.129917 1209 275.3333333 933.6666667
RcERF046 RcERF081 0.3163392 1.85921206 0.1701469 609 153.4166667 455.5833333
RcERF025 RcERF088 0.57783254 1.78941311 0.3229174 708 160.9166667 547.0833333
RcERF064 RcERF092 0.35723109 NaN NaN 699 158 541
RcERF063 RcERF093 0.36996467 1.47353077 0.2510736 432 104.4166667 327.5833333
RcERF070 RcERF098 0.6685266 1.81097809 0.3691522 753 174 579
RcERF021 RcERF100 0.38250295 1.50870683 0.2535303 612 138.9166667 473.0833333
RcERF040 RcERF101 0.27568714 NaN NaN 561 126.0833333 434.9166667
RcERF022 RcERF103 0.41399228 1.28764002 0.3215124 735 178.9166667 556.0833333
RcERF031 RcERF104 0.27070983 1.29444056 0.2091327 429 104.0833333 324.9166667
RcERF032 RcERF105 0.27018563 1.27442854 0.2120053 1797 397.1666667 1399.833333
RcERF074 RcERF107 0.76307193 NaN NaN 969 216.1666667 752.8333333
RcERF072 RcERF109 0.57052476 1.55144847 0.3677368 684 155.4166667 528.5833333
RcERF009 RcERF112 0.56506363 2.56420719 0.2203658 852 194.25 657.75
RcERF020 RcERF112 0.48408323 NaN NaN 972 229.5 742.5
RcERF019 RcERF119 0.62960209 2.53219954 0.2486384 666 161.75 504.25
RcERF003 RcERF123 0.5452034 2.76643897 0.1970777 759 188.8333333 570.1666667
RcERF034 RcERF131 0.34870274 1.21479419 0.2870468 1011 238.8333333 772.1666667