Skip to main content

Table 1 Features of WRKY genes identified in cucumber

From: Genome-wide analysis of the WRKY gene family in the cucumber genome and transcriptome-wide identification of WRKY transcription factors that respond to biotic and abiotic stresses

Name

Gene ID (V3)

ORF

Intron number

AA

WRKY domain

Group

Conserved heptapeptide

Zinc-finger type

Domain

number

CsWRKY1

CsaV3_1G002180

1773

4

590

WRKYGQK

C2H2

1

II b

CsWRKY2

CsaV3_1G004720

1731

4

576

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY3

CsaV3_1G007870

1845

3

614

WRKYGQK

C2H2

1

II b

CsWRKY4

CsaV3_1G028960

1521

4

506

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY5

CsaV3_1G032000

849

2

282

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY6

CsaV3_1G033110

858

2

285

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY7

CsaV3_1G037680

1242

2

413

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY8

CsaV3_1G044520

3357

6

1,118

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY9

CsaV3_2G013650

1047

2

348

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY10

CsaV3_2G017720

618

2

205

WRKYGKK

C2H2

1

II c

CsWRKY11

CsaV3_2G017760

741

3

246

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY12

CsaV3_2G032460

939

3

312

WRKYGQK

C2H2

1

II a

CsWRKY13

CsaV3_2G032470

612

3

203

WRKYGQK

C2H2

1

II a

CsWRKY14

CsaV3_2G034030

681

2

226

WRKYGQK

C2

1

II c

CsWRKY15

CsaV3_2G035630

882

2

293

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY16

CsaV3_3G003840

2244

4

747

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY17

CsaV3_3G004410

1602

5

533

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY18

CsaV3_3G007160

660

3

219

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY19

CsaV3_3G008170

1014

2

337

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY20

CsaV3_3G008580

546

1

181

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY21

CsaV3_3G008610

1011

2

336

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY22

CsaV3_3G015290

972

2

323

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY23

CsaV3_3G018790

1521

4

506

WRKYGQK

C2H2

1

II b

CsWRKY24

CsaV3_3G021980

1101

2

366

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY25

CsaV3_3G026600

999

3

332

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY26

CsaV3_3G026920

513

1

170

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY27

CsaV3_3G033000

990

1

329

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY28

CsaV3_3G033350

1431

4

476

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY29

CsaV3_3G035430

1419

4

472

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY30

CsaV3_3G047140

1053

2

350

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY31

CsaV3_4G001260

873

2

290

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY32

CsaV3_4G003030

648

1

215

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY33

CsaV3_4G006110

810

1

269

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY34

CsaV3_4G006120

603

1

200

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY35

CsaV3_4G006480

1068

2

355

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY36

CsaV3_4G025110

840

2

279

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY37

CsaV3_4G034570

1176

2

391

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY38

CsaV3_4G036610

981

4

326

WRKYGQK

C2H2

1

II a

CsWRKY39

CsaV3_5G001010

1035

2

344

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY40

CsaV3_5G011060

639

1

212

WRKYGQK

-

1

III

CsWRKY41

CsaV3_5G011080

849

2

282

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY42

CsaV3_5G033090

1173

3

390

WRKYGQK

C2H2

1

I

CsWRKY43

CsaV3_5G038330

1521

3

506

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY44

CsaV3_6G013820

921

2

306

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY45

CsaV3_6G018960

1287

4

428

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY46

CsaV3_6G028510

1359

4

452

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY47

CsaV3_6G032100

360

3

119

WRKYGKK

C2

1

II c

CsWRKY48

CsaV3_6G032480

921

2

306

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY49

CsaV3_6G042200

735

2

244

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY50

CsaV3_6G042280

600

2

199

WRKYGKK

C2H2

1

II c

CsWRKY51

CsaV3_6G043450

885

2

294

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY52

CsaV3_6G048830

1872

5

623

WRKYGQK

C2H2

1

II b

CsWRKY53

CsaV3_6G051490

786

2

261

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY54

CsaV3_6G052610

1566

2

521

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY55

CsaV3_7G002670

1302

4

433

WRKYGQK/WRKYGQK

C2H2

2

I

CsWRKY56

CsaV3_7G003470

1608

4

535

WRKYGQK

C2H2

1

II-b

CsWRKY57

CsaV3_7G005750

897

2

298

WRKYGQK

C2H2

1

II e

CsWRKY58

CsaV3_7G022650

894

2

297

WRKYGQK

C2H2

1

II c

CsWRKY59

CsaV3_7G025370

891

2

296

WRKYGQK

C2HC

1

III

CsWRKY60

CsaV3_7G027490

768

3

255

WRKYGQK

C2H2

1

II d

CsWRKY61

CsaV3_7G030110

729

2

242

WRKYGQK

C2H2

1

II c