Skip to main content

Table 1 Features of WRKY genes identified in cucumber

From: Genome-wide analysis of the WRKY gene family in the cucumber genome and transcriptome-wide identification of WRKY transcription factors that respond to biotic and abiotic stresses

Name Gene ID (V3) ORF Intron number AA WRKY domain Group
Conserved heptapeptide Zinc-finger type Domain
number
CsWRKY1 CsaV3_1G002180 1773 4 590 WRKYGQK C2H2 1 II b
CsWRKY2 CsaV3_1G004720 1731 4 576 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY3 CsaV3_1G007870 1845 3 614 WRKYGQK C2H2 1 II b
CsWRKY4 CsaV3_1G028960 1521 4 506 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY5 CsaV3_1G032000 849 2 282 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY6 CsaV3_1G033110 858 2 285 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY7 CsaV3_1G037680 1242 2 413 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY8 CsaV3_1G044520 3357 6 1,118 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY9 CsaV3_2G013650 1047 2 348 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY10 CsaV3_2G017720 618 2 205 WRKYGKK C2H2 1 II c
CsWRKY11 CsaV3_2G017760 741 3 246 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY12 CsaV3_2G032460 939 3 312 WRKYGQK C2H2 1 II a
CsWRKY13 CsaV3_2G032470 612 3 203 WRKYGQK C2H2 1 II a
CsWRKY14 CsaV3_2G034030 681 2 226 WRKYGQK C2 1 II c
CsWRKY15 CsaV3_2G035630 882 2 293 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY16 CsaV3_3G003840 2244 4 747 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY17 CsaV3_3G004410 1602 5 533 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY18 CsaV3_3G007160 660 3 219 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY19 CsaV3_3G008170 1014 2 337 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY20 CsaV3_3G008580 546 1 181 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY21 CsaV3_3G008610 1011 2 336 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY22 CsaV3_3G015290 972 2 323 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY23 CsaV3_3G018790 1521 4 506 WRKYGQK C2H2 1 II b
CsWRKY24 CsaV3_3G021980 1101 2 366 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY25 CsaV3_3G026600 999 3 332 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY26 CsaV3_3G026920 513 1 170 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY27 CsaV3_3G033000 990 1 329 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY28 CsaV3_3G033350 1431 4 476 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY29 CsaV3_3G035430 1419 4 472 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY30 CsaV3_3G047140 1053 2 350 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY31 CsaV3_4G001260 873 2 290 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY32 CsaV3_4G003030 648 1 215 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY33 CsaV3_4G006110 810 1 269 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY34 CsaV3_4G006120 603 1 200 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY35 CsaV3_4G006480 1068 2 355 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY36 CsaV3_4G025110 840 2 279 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY37 CsaV3_4G034570 1176 2 391 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY38 CsaV3_4G036610 981 4 326 WRKYGQK C2H2 1 II a
CsWRKY39 CsaV3_5G001010 1035 2 344 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY40 CsaV3_5G011060 639 1 212 WRKYGQK - 1 III
CsWRKY41 CsaV3_5G011080 849 2 282 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY42 CsaV3_5G033090 1173 3 390 WRKYGQK C2H2 1 I
CsWRKY43 CsaV3_5G038330 1521 3 506 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY44 CsaV3_6G013820 921 2 306 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY45 CsaV3_6G018960 1287 4 428 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY46 CsaV3_6G028510 1359 4 452 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY47 CsaV3_6G032100 360 3 119 WRKYGKK C2 1 II c
CsWRKY48 CsaV3_6G032480 921 2 306 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY49 CsaV3_6G042200 735 2 244 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY50 CsaV3_6G042280 600 2 199 WRKYGKK C2H2 1 II c
CsWRKY51 CsaV3_6G043450 885 2 294 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY52 CsaV3_6G048830 1872 5 623 WRKYGQK C2H2 1 II b
CsWRKY53 CsaV3_6G051490 786 2 261 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY54 CsaV3_6G052610 1566 2 521 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY55 CsaV3_7G002670 1302 4 433 WRKYGQK/WRKYGQK C2H2 2 I
CsWRKY56 CsaV3_7G003470 1608 4 535 WRKYGQK C2H2 1 II-b
CsWRKY57 CsaV3_7G005750 897 2 298 WRKYGQK C2H2 1 II e
CsWRKY58 CsaV3_7G022650 894 2 297 WRKYGQK C2H2 1 II c
CsWRKY59 CsaV3_7G025370 891 2 296 WRKYGQK C2HC 1 III
CsWRKY60 CsaV3_7G027490 768 3 255 WRKYGQK C2H2 1 II d
CsWRKY61 CsaV3_7G030110 729 2 242 WRKYGQK C2H2 1 II c