Genome-wide trait-trait dynamics correlation study dissects the gene regulation pattern in maize kernels

Xu, Xiuqin; Wang, Min; Li, Lianbo; Che, Ronghui; Li, Peng; Pei, Laming; Li, Hui

doi:10.1186/s12870-017-1119-y

BMC Plant Biology

Table 1 The top 50 triplets with the highest LA scores in a genome-wide LA analysis

From: Genome-wide trait-trait dynamics correlation study dissects the gene regulation pattern in maize kernels

X	Y	Z	LA	(Y,Z)\|X	(X,Z)\|Y	(X,Y)\|Z
AF546188.1_FG003	AF546188.1_FG002	AF546188.1_FG001	−0.72	−0.03	−0.42	−0.43
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G122520	−0.71	−0.25	−0.34	−0.47
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G161750	−0.70	−0.19	−0.30	−0.40
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G150524	−0.69	−0.23	−0.29	−0.43
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G156578	−0.69	−0.23	−0.28	−0.38
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM5G813474	−0.69	−0.24	−0.29	−0.42
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G093035	−0.69	−0.28	−0.32	−0.42
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G483598	−0.68	−0.27	−0.30	−0.40
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM5G837022	−0.68	−0.28	−0.29	−0.45
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM5G822819	−0.68	−0.20	−0.25	−0.45
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM2G003461	−0.67	−0.24	−0.28	−0.37
GRMZM2G033626	GRMZM2G446426	GRMZM2G388576	0.67	0.20	0.41	0.44
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G040079	0.66	0.30	0.35	0.36
GRMZM2G181362	GRMZM2G046932	GRMZM2G008226	−0.65	−0.25	−0.29	−0.33
GRMZM2G064133	GRMZM2G082271	GRMZM2G008226	0.65	0.22	0.31	0.35
GRMZM2G096010	GRMZM5G891343	GRMZM2G396773	0.65	0.15	0.33	0.42
GRMZM2G008607	GRMZM2G146283	GRMZM2G090869	−0.65	−0.30	−0.33	−0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G156818	GRMZM2G101635	0.64	0.14	0.29	0.31
GRMZM2G025703	GRMZM2G180612	GRMZM2G146283	0.64	0.31	0.32	0.33
GRMZM2G010797	GRMZM2G035118	GRMZM2G060611	0.64	0.30	0.32	0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G321753	0.64	0.28	0.37	0.38
GRMZM2G126821	GRMZM2G082271	GRMZM2G008226	0.64	0.22	0.33	0.36
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G321753	0.64	0.17	0.33	0.36
GRMZM5G821988	GRMZM2G179024	GRMZM2G072894	−0.64	−0.19	−0.30	−0.35
GRMZM2G119483	GRMZM2G035118	GRMZM2G046932	0.64	0.29	0.34	0.34
GRMZM2G172980	GRMZM2G134020	GRMZM5G884722	−0.64	−0.25	−0.33	−0.43
GRMZM2G064133	GRMZM2G056393	GRMZM2G008226	0.64	0.24	0.33	0.35
GRMZM2G010797	GRMZM5G876621	GRMZM2G060611	0.64	0.25	0.33	0.35
GRMZM2G010037	AC196475.3_FG005	GRMZM2G032852	0.64	0.19	0.33	0.35
GRMZM2G375222	GRMZM2G179024	GRMZM2G072894	−0.64	−0.17	−0.33	−0.35
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G467169	0.63	0.17	0.29	0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G035395	GRMZM2G056099	0.63	0.23	0.34	0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G447745	0.63	0.26	0.32	0.33
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G127632	0.63	0.30	0.33	0.36
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G168096	0.63	0.19	0.29	0.38
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G168096	0.63	0.28	0.33	0.36
GRMZM2G025703	GRMZM2G040207	GRMZM2G401050	0.63	0.21	0.33	0.37
GRMZM2G009598	GRMZM2G056099	GRMZM2G104047	0.63	0.27	0.32	0.35
GRMZM2G126821	GRMZM2G094123	GRMZM2G008226	0.63	0.25	0.33	0.36
GRMZM2G174479	GRMZM2G147671	GRMZM2G177599	−0.63	−0.35	−0.36	−0.37
GRMZM2G043417	GRMZM2G075683	GRMZM2G146283	0.63	0.31	0.31	0.32
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G331368	0.63	0.16	0.29	0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G156818	GRMZM2G040247	0.63	0.12	0.32	0.35
GRMZM2G111022	GRMZM2G046932	GRMZM2G008226	0.63	0.24	0.28	0.34
GRMZM2G010797	GRMZM2G064145	GRMZM2G401050	0.63	0.18	0.32	0.34
GRMZM2G110402	GRMZM2G040207	GRMZM2G119703	0.63	0.25	0.32	0.34
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G123660	0.63	0.17	0.28	0.32
GRMZM2G009598	GRMZM2G138425	GRMZM2G091151	0.63	0.30	0.32	0.33
GRMZM2G153792	GRMZM2G179024	GRMZM2G072894	−0.63	−0.20	−0.33	−0.35
GRMZM2G009598	GRMZM2G101635	GRMZM2G097068	0.63	0.19	0.29	0.33

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ISSN: 1471-2229

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