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Table 2 SSR primers used for screening G. anomalum chromosomes in the alien addition lines

From: Characterization of eleven monosomic alien addition lines added from Gossypium anomalum to Gossypium hirsutum using improved GISH and SSR markers

Chromosome

1Ba

2Ba

3Ba

4Ba

5Ba

6Ba

7Ba

8Ba

9Ba

10Ba

11Ba

12Ba

13Ba

 

NAU7675-120

NAU1847-200

NAU2836-230

NAU6966-200

NAU3095-260

NAU3677-160

NAU8250-220

NAU0104-230

NAU3100-170

NAU7772-160

NAU8254-160

NAU3084-250

NAU6582-550

 

NAU3347-250

NAU3733-200

NAU0093-130

NAU0210-200

NAU2503-250

NAU2679-150

NAU7974-150

NAU8183-160

NAU1886-150

NAU2543-190

NAU7698-160

NAU0206-100

NAU6426-370

 

NAU7914-160

NAU0645-130

NAU5675-180

NAU0012-230

NAU3183-230

NAU1454-200

NAU2556-250

NAU0738-230

NAU3888-220

NAU3917-180

NAU3731-300

NAU5397-160

NAU3011-220

 

NAU3714-190

NAU8013-220

NAU0354-180

NAU0569-160

NAU0144-250

NAU1987-160

NAU2974-150

NAU2876-200

NAU6701-200

NAU4071-220

NAU0133-120

NAU7007-150

NAU7727-250

 

NAU0072-180

NAU5490-280

NAU0200-410

NAU3508-200

NAU6205-160

NAU2397-270

NAU0300-120

NAU5130-320

NAU0148-170

NAU7900-150

NAU0646-140

NAU3905-150

NAU3948-250

 

NAU3337-320

NAU5421-210

NAU3875-210

NAU0146-180

NAU4055-170

NAU6347-170

NAU4017-220

NAU7616-150

NAU6848-150

NAU3531-210

NAU7140-150

NAU2715-200

NAU0039-110

 

NAU6624-220

NAU1778-100

NAU0088-140

NAU0033-150

NAU0378-180

NAU0783-180

NAU0121-200

NAU0583-300

NAU2753-250

NAU3665-220

NAU5418-160

NAU7838-150

NAU8306-130

 

NAU0107-110

NAU6474-300

NAU3700-180

NAU7579-140

NAU6406-200

NAU0356-170

NAU3594-110

NAU5335-150

NAU0075-130

NAU0922-200

NAU6999-420

NAU8230-170

NAU2443-140

 

NAU7670-150

NAU7809-200

NAU2908-200

NAU7290-230

NAU5486-200

NAU4682-150

NAU4956-280

NAU6389-270

NAU7815-250

NAU3137-300

NAU5212-200

NAU7719-200

NAU7738-160

 

NAU1495-170

NAU3598-200

NAU8203-230

NAU7946-150

NAU2944-180

NAU2714-170

NAU2820-200

NAU0435-180

NAU6984-200

NAU4881-240

NAU2361-250

NAU7824-190

NAU6738-130

 

NAU6095-170

NAU3820-110

NAU3292-270

NAU6993-150

NAU0123-120

 

NAU7686-180

NAU0069-160

NAU7743-130

NAU8079-200

NAU3373-220

NAU1274-210

NAU4871-150

  

NAU1702-180

NAU5111-230

 

NAU6830-150

 

NAU2597-180

NAU3904-190

NAU0799-210

NAU0142-500

NAU2602-270

NAU8006-160

NAU3447-110

   

NAU0805-190

 

NAU7747-160

 

NAU7692-150

NAU0298-130

NAU8120-320

NAU7983-170

NAU6809-160

  
     

NAU2655-170

   

NAU0245-110

 

NAU6315-180

  
     

NAU7015-150

   

NAU0864-240

 

NAU6267-180

  
     

NAU3826-420

   

NAU4477-250

 

NAU6520-200

  
     

NAU3609-250

        
     

NAU3656-210

        

Total

11

12

13

11

18

10

13

13

16

13

16

12

12

Position

8.20-120.01

0.00-107.44

3.23-126.25

0.00-113.51

10.90-189.98

13.32-121.59

2.85-121.07

0.00-149.89

0.00-148.34

15.49-111.16

12.11-156.15

0.00-108.09

7.24-106.43

GDC (cM/)a

111.81

107.44

123.02

113.51

179.08

108.27

118.22

149.89

148.34

95.67

144.04

108.09

99.19

Mean densityb

10.16

8.95

9.46

10.32

9.95

10.83

9.09

11.53

9.27

7.36

9.00

9.01

8.27

PCC (%)c

88.93

95.88

97.44

88.94

94.27

78.54

91.35

90.33

98.14

82.84

79.51

80.86

84.64

  1. Note: aGDC genetic distance coverage (cM); bGenetic distance (cM) between two adjacent markers on a chromosome; cPercentage of chromosome covered by markers (%)