TY - CHAP AU - Bompard, J. ED - Litz, R. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Taxonomy and systematics BT - The mango: Botany, production and uses PB - CAB International CY - Wallingford UR - https://doi.org/10.1079/9781845934897.0019 DO - 10.1079/9781845934897.0019 ID - Bompard2009 ER - TY - CHAP AU - Mukherjee, S. AU - Litz, R. ED - Litz, R. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Introduction: botany and importance BT - The mango: Botany, production and uses PB - CAB international CY - Wallingford UR - https://doi.org/10.1079/9781845934897.0001 DO - 10.1079/9781845934897.0001 ID - Mukherjee2009 ER - TY - JOUR AU - Olano, C. T. AU - Schnell, R. J. AU - Quintanilla, W. E. AU - Campbell, R. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Pedigree analysis of Florida mango cultivars JO - Proc Fla State Hort Soc VL - 118 ID - Olano2005 ER - TY - CHAP AU - Bally, I. E. AU - Lu, P. AU - Johnson, P. ED - Jain, S. M. ED - Priyadarshan, P. M. PY - 2009 DA - 2009// TI - Mango breeding BT - Breeding plantation tree crops: tropical species PB - Springer CY - New York UR - https://doi.org/10.1007/978-0-387-71201-7_2 DO - 10.1007/978-0-387-71201-7_2 ID - Bally2009 ER - TY - JOUR AU - Varshney, R. K. AU - Graner, A. AU - Sorrells, M. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genomics-assisted breeding for crop improvement JO - Trends Plant Sci VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/j.tplants.2005.10.004 DO - 10.1016/j.tplants.2005.10.004 ID - Varshney2005 ER - TY - JOUR AU - Kashkush, K. AU - Fang, J. AU - Tomer, E. AU - Hillel, J. AU - Lavi, U. PY - 2001 DA - 2001// TI - Cultivar identification and genetic map of mango (Mangifera indica) JO - Euphytica VL - 122 UR - https://doi.org/10.1023/A:1012646331258 DO - 10.1023/A:1012646331258 ID - Kashkush2001 ER - TY - JOUR AU - Adato, A. AU - Sharon, D. AU - Lavi, U. AU - Hillel, J. AU - Gazit, S. PY - 1995 DA - 1995// TI - Application of DNA fingerprints for identification and genetic analyses of mango (Mangifera indica) genotypes JO - J Am Soc Hortic Sci VL - 120 ID - Adato1995 ER - TY - JOUR AU - Eiadthong, W. AU - Yonemori, K. AU - Sugiura, A. AU - Utsunomiya, N. AU - Subhadrabandhu, S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Identification of mango cultivars of Thailand and evaluation of their genetic variation using the amplified fragments by simple sequence repeat-(SSR-) anchored primers JO - Sci Hortic VL - 82 UR - https://doi.org/10.1016/S0304-4238(99)00036-9 DO - 10.1016/S0304-4238(99)00036-9 ID - Eiadthong1999 ER - TY - JOUR AU - Schnell, R. J. AU - Olano, C. T. AU - Quintanilla, W. E. AU - Meerow, A. W. PY - 2005 DA - 2005// TI - Isolation and characterization of 15 microsatellite loci from mango (Mangifera indica L.) and cross-species amplification in closely related taxa JO - Mol Ecol Notes VL - 5 UR - https://doi.org/10.1111/j.1471-8286.2005.01018.x DO - 10.1111/j.1471-8286.2005.01018.x ID - Schnell2005 ER - TY - JOUR AU - Ahmad Rajwana, I. AU - Tabbasam, N. AU - Malik, A. U. AU - Malik, S. A. AU - Mehboob-ur-Rahman AU - Zafar, Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - Assessment of genetic diversity among mango (Mangifera indica L.) genotypes using RAPD markers JO - Sci Hortic VL - 117 UR - https://doi.org/10.1016/j.scienta.2008.04.009 DO - 10.1016/j.scienta.2008.04.009 ID - Ahmad Rajwana2008 ER - TY - JOUR AU - Díaz-Matallana, M. AU - Schuler-García, I. AU - Ruiz-García, M. AU - Hodson de Jaramillo, E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Analysis of diversity among six populations of Colombian mango (Mangifera indica L. cvar. Hilacha) using RAPDs markers JO - Electron J Biotechnol VL - 12 ID - Díaz-Matallana2009 ER - TY - JOUR AU - Hirano, R. AU - Htun Oo, T. AU - Watanabe, K. N. PY - 2010 DA - 2010// TI - Myanmar mango landraces reveal genetic uniqueness over common cultivars from Florida, India, and Southeast Asia JO - Genome VL - 53 UR - https://doi.org/10.1139/G10-005 DO - 10.1139/G10-005 ID - Hirano2010 ER - TY - JOUR AU - Dillon, N. L. AU - Bally, I. S. E. AU - Wright, C. L. AU - Hucks, L. AU - Innes, D. J. AU - Dietzgen, R. G. PY - 2013 DA - 2013// TI - Genetic diversity of the Australian National Mango Genebank JO - Sci Hortic VL - 150 UR - https://doi.org/10.1016/j.scienta.2012.11.003 DO - 10.1016/j.scienta.2012.11.003 ID - Dillon2013 ER - TY - STD TI - Ravishankar KV, Bommisetty P, Bajpai A, Srivastava N, Mani BH, Vasugi C, et al. Genetic diversity and population structure analysis of mango (Mangifera indica) cultivars assessed by microsatellite markers. Trees. 2015;1–9. ID - ref14 ER - TY - JOUR AU - Schnell, R. J. AU - Ronning, C. M. AU - Jr, R. J. K. PY - 1995 DA - 1995// TI - Identification of cultivars and validation of genetic relationships in Mangifera indica L. using RAPD markers JO - Theor Appl Genet VL - 90 UR - https://doi.org/10.1007/BF00222213 DO - 10.1007/BF00222213 ID - Schnell1995 ER - TY - JOUR AU - Ravishankar, K. V. AU - Anand, L. AU - Dinesh, M. R. PY - 2000 DA - 2000// TI - Assessment of genetic relatedness among mango cultivars of India using RAPD markers JO - J Hortic Sci Biotechnol VL - 75 ID - Ravishankar2000 ER - TY - JOUR AU - Karihaloo, J. AU - Dwivedi, Y. AU - Archak, S. AU - Gaikwad, A. B. PY - 2003 DA - 2003// TI - Analysis of genetic diversity of Indian mango cultivars using RAPD markers JO - J Hortic Sci Biotechnol VL - 78 ID - Karihaloo2003 ER - TY - JOUR AU - Viruel, M. AU - Escribano, P. AU - Barbieri, M. AU - Ferri, M. AU - Hormaza, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Fingerprinting, embryo type and geographic differentiation in mango (Mangifera indica L., Anacardiaceae) with microsatellites JO - Mol Breed VL - 15 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-004-7982-x DO - 10.1007/s11032-004-7982-x ID - Viruel2005 ER - TY - JOUR AU - Surapaneni, M. AU - Vemireddy, L. R. AU - Begum, H. AU - Reddy, B. P. AU - Neetasri, C. AU - Nagaraju, J. AU - Anwar, S. Y. AU - Siddiq, E. A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Population structure and genetic analysis of different utility types of mango (Mangifera indica L.) germplasm of Andhra Pradesh state of India using microsatellite markers JO - Plant Syst Evol VL - 299 UR - https://doi.org/10.1007/s00606-013-0790-1 DO - 10.1007/s00606-013-0790-1 ID - Surapaneni2013 ER - TY - JOUR AU - Dillon, N. L. AU - Innes, D. J. AU - Bally, I. S. AU - Wright, C. L. AU - Devitt, L. C. AU - Dietzgen, R. G. PY - 2014 DA - 2014// TI - Expressed sequence tag-simple sequence repeat (EST-SSR) marker resources for diversity analysis of mango (Mangifera indica L.) JO - Diversity VL - 6 UR - https://doi.org/10.3390/d6010072 DO - 10.3390/d6010072 ID - Dillon2014 ER - TY - JOUR AU - Azim, M. K. AU - Khan, I. A. AU - Zhang, Y. PY - 2014 DA - 2014// TI - Characterization of mango (Mangifera indica L.) transcriptome and chloroplast genome JO - Plant Mol Biol VL - 85 UR - https://doi.org/10.1007/s11103-014-0179-8 DO - 10.1007/s11103-014-0179-8 ID - Azim2014 ER - TY - JOUR AU - Pandit, S. S. AU - Kulkarni, R. S. AU - Giri, A. P. AU - Köllner, T. G. AU - Degenhardt, J. AU - Gershenzon, J. AU - Gupta, V. S. PY - 2010 DA - 2010// TI - Expression profiling of various genes during the fruit development and ripening of mango JO - Plant Physiol Biochem VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2010.02.012 DO - 10.1016/j.plaphy.2010.02.012 ID - Pandit2010 ER - TY - JOUR AU - Luria, N. AU - Sela, N. AU - Yaari, M. AU - Feygenberg, O. AU - Kobiler, I. AU - Lers, A. AU - Prusky, D. PY - 2014 DA - 2014// TI - De-novo assembly of mango fruit peel transcriptome reveals mechanisms of mango response to hot water treatment JO - BMC Genomics VL - 15 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-15-957 DO - 10.1186/1471-2164-15-957 ID - Luria2014 ER - TY - JOUR AU - Wu, H. AU - Jia, H. AU - Ma, X. AU - Wang, S. AU - Yao, Q. AU - Xu, W. AU - Zhou, Y. AU - Gao, Z. AU - Zhan, R. PY - 2014 DA - 2014// TI - Transcriptome and proteomic analysis of mango (Mangifera indica Linn) fruits JO - J Proteomics VL - 105 UR - https://doi.org/10.1016/j.jprot.2014.03.030 DO - 10.1016/j.jprot.2014.03.030 ID - Wu2014 ER - TY - JOUR AU - Dautt-Castro, M. AU - Ochoa-Leyva, A. AU - Contreras-Vergara, C. A. AU - Pacheco-Sanchez, M. A. AU - Casas-Flores, S. AU - Sanchez-Flores, A. AU - Kuhn, D. N. AU - Islas-Osuna, M. A. PY - 2015 DA - 2015// TI - Mango (Mangifera indica L.) cv. Kent fruit mesocarp de novo transcriptome assembly identifies gene families important for ripening JO - Front Plant Sci VL - 6 UR - https://doi.org/10.3389/fpls.2015.00062 DO - 10.3389/fpls.2015.00062 ID - Dautt-Castro2015 ER - TY - JOUR AU - Davey, J. W. AU - Hohenlohe, P. A. AU - Etter, P. D. AU - Boone, J. Q. AU - Catchen, J. M. AU - Blaxter, M. L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genome-wide genetic marker discovery and genotyping using next-generation sequencing JO - Nat Rev Genet VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nrg3012 DO - 10.1038/nrg3012 ID - Davey2011 ER - TY - JOUR AU - Novaes, E. AU - Drost, D. R. AU - Farmerie, W. G. AU - Pappas, G. J. AU - Grattapaglia, D. AU - Sederoff, R. R. AU - Kirst, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - High-throughput gene and SNP discovery in Eucalyptus grandis, an uncharacterized genome JO - BMC Genomics VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-312 DO - 10.1186/1471-2164-9-312 ID - Novaes2008 ER - TY - JOUR AU - Barakat, A. AU - DiLoreto, D. S. AU - Zhang, Y. AU - Smith, C. AU - Baier, K. AU - Powell, W. A. AU - Wheeler, N. AU - Sederoff, R. AU - Carlson, J. E. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparison of the transcriptomes of American chestnut (Castanea dentata) and Chinese chestnut (Castanea mollissima) in response to the chestnut blight infection JO - BMC Plant Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-9-51 DO - 10.1186/1471-2229-9-51 ID - Barakat2009 ER - TY - JOUR AU - Alagna, F. AU - Agostino, N. D. ’. AU - Torchia, L. AU - Servili, M. AU - Rao, R. AU - Pietrella, M. AU - Giuliano, G. AU - Chiusano, M. L. AU - Baldoni, L. AU - Perrotta, G. PY - 2009 DA - 2009// TI - Comparative 454 pyrosequencing of transcripts from two olive genotypes during fruit development JO - BMC Genomics VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-10-399 DO - 10.1186/1471-2164-10-399 ID - Alagna2009 ER - TY - JOUR AU - Iorizzo, M. AU - Senalik, D. A. AU - Grzebelus, D. AU - Bowman, M. AU - Cavagnaro, P. F. AU - Matvienko, M. AU - Ashrafi, H. AU - Deynze, A. V. AU - Simon, P. W. PY - 2011 DA - 2011// TI - De novo assembly and characterization of the carrot transcriptome reveals novel genes, new markers, and genetic diversity JO - BMC Genomics VL - 12 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-12-389 DO - 10.1186/1471-2164-12-389 ID - Iorizzo2011 ER - TY - JOUR AU - Ophir, R. AU - Sherman, A. AU - Rubinstein, M. AU - Eshed, R. AU - Sharabi Schwager, M. AU - Harel-Beja, R. AU - Bar-Ya’akov, I. AU - Holland, D. PY - 2014 DA - 2014// TI - Single-nucleotide polymorphism markers from de-novo assembly of the pomegranate transcriptome reveal germplasm genetic diversity JO - PLoS ONE VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0088998 DO - 10.1371/journal.pone.0088998 ID - Ophir2014 ER - TY - JOUR AU - Chen, H. AU - Xie, W. AU - He, H. AU - Yu, H. AU - Chen, W. AU - Li, J. AU - Yu, R. AU - Yao, Y. AU - Zhang, W. AU - He, Y. AU - Tang, X. AU - Zhou, F. AU - Deng, X. W. AU - Zhang, Q. PY - 2014 DA - 2014// TI - A high-density SNP genotyping array for rice biology and molecular breeding JO - Mol Plant VL - 7 UR - https://doi.org/10.1093/mp/sst135 DO - 10.1093/mp/sst135 ID - Chen2014 ER - TY - JOUR AU - Nielsen, R. AU - Paul, J. S. AU - Albrechtsen, A. AU - Song, Y. S. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genotype and SNP calling from next-generation sequencing data JO - Nat Rev Genet VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2986 DO - 10.1038/nrg2986 ID - Nielsen2011 ER - TY - JOUR AU - Huang, X. AU - Madan, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - CAP3: A DNA sequence assembly program JO - Genome Res VL - 9 UR - https://doi.org/10.1101/gr.9.9.868 DO - 10.1101/gr.9.9.868 ID - Huang1999 ER - TY - JOUR AU - McCouch, S. R. AU - Zhao, K. AU - Wright, M. AU - Tung, C. -. W. AU - Ebana, K. AU - Thomson, M. AU - Reynolds, A. AU - Wang, D. AU - DeClerck, G. AU - Ali, M. L. AU - McClung, A. AU - Eizenga, G. AU - Bustamante, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Development of genome-wide SNP assays for rice JO - Breed Sci VL - 60 UR - https://doi.org/10.1270/jsbbs.60.524 DO - 10.1270/jsbbs.60.524 ID - McCouch2010 ER - TY - JOUR AU - Zhang, W. -. W. AU - Pan, J. -. S. AU - He, H. -. L. AU - Zhang, C. AU - Li, Z. AU - Zhao, J. -. L. AU - Yuan, X. -. J. AU - Zhu, L. -. H. AU - Huang, S. -. W. AU - Cai, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - Construction of a high density integrated genetic map for cucumber (Cucumis sativus L.) JO - Theor Appl Genet VL - 124 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1701-x DO - 10.1007/s00122-011-1701-x ID - Zhang2012 ER - TY - JOUR AU - Ravishankar, K. V. AU - Mani, B. H. -. R. AU - Anand, L. AU - Dinesh, M. R. PY - 2011 DA - 2011// TI - Development of new microsatellite markers from Mango (Mangifera indica) and cross-species amplification JO - Am J Bot VL - 98 UR - https://doi.org/10.3732/ajb.1000263 DO - 10.3732/ajb.1000263 ID - Ravishankar2011 ER - TY - JOUR AU - Tsai, C. -. C. AU - Chen, Y. -. K. H. AU - Chen, C. -. H. AU - Weng, I. S. AU - Tsai, C. -. M. AU - Lee, S. -. R. AU - Lin, Y. -. S. AU - Chiang, Y. -. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - Cultivar identification and genetic relationship of mango (Mangifera indica) in Taiwan using 37 SSR markers JO - Sci Hortic VL - 164 UR - https://doi.org/10.1016/j.scienta.2013.09.037 DO - 10.1016/j.scienta.2013.09.037 ID - Tsai2013 ER - TY - JOUR AU - Stackelberg, M. AU - Rensing, S. A. AU - Reski, R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Identification of genic moss SSR markers and a comparative analysis of twenty-four algal and plant gene indices reveal species-specific rather than group-specific characteristics of microsatellites JO - BMC Plant Biol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-6-9 DO - 10.1186/1471-2229-6-9 ID - Stackelberg2006 ER - TY - JOUR AU - Sharma, P. C. AU - Grover, A. AU - Kahl, G. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mining microsatellites in eukaryotic genomes JO - Trends Biotechnol VL - 25 UR - https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2007.07.013 DO - 10.1016/j.tibtech.2007.07.013 ID - Sharma2007 ER - TY - JOUR AU - Cutler, D. J. AU - Zwick, M. E. AU - Carrasquillo, M. M. AU - Yohn, C. T. AU - Tobin, K. P. AU - Kashuk, C. AU - Mathews, D. J. AU - Shah, N. A. AU - Eichler, E. E. AU - Warrington, J. A. AU - Chakravarti, A. PY - 2001 DA - 2001// TI - High-throughput variation detection and genotyping using microarrays JO - Genome Res VL - 11 ID - Cutler2001 ER - TY - JOUR AU - Edwards, J. D. AU - Janda, J. AU - Sweeney, M. T. AU - Gaikwad, A. B. AU - Liu, B. AU - Leung, H. AU - Galbraith, D. W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Development and evaluation of a high-throughput, low-cost genotyping platform based on oligonucleotide microarrays in rice JO - Plant Methods VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1746-4811-4-13 DO - 10.1186/1746-4811-4-13 ID - Edwards2008 ER - TY - JOUR AU - Verde, I. AU - Bassil, N. AU - Scalabrin, S. AU - Gilmore, B. AU - Lawley, C. T. AU - Gasic, K. AU - Micheletti, D. AU - Rosyara, U. R. AU - Cattonaro, F. AU - Vendramin, E. AU - Main, D. AU - Aramini, V. AU - Blas, A. L. AU - Mockler, T. C. AU - Bryant, D. W. AU - Wilhelm, L. AU - Troggio, M. AU - Sosinski, B. AU - Aranzana, M. J. AU - Arus, P. AU - Iezzoni, A. AU - Morgante, M. AU - Peace, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Development and evaluation of a 9K SNP array for peach by internationally coordinated SNP detection and validation in breeding germplasm JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0035668 DO - 10.1371/journal.pone.0035668 ID - Verde2012 ER - TY - JOUR AU - Xu, Y. AU - Lu, Y. AU - Xie, C. AU - Gao, S. AU - Wan, J. AU - Prasanna, B. M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Whole-genome strategies for marker-assisted plant breeding JO - Mol Breed VL - 29 UR - https://doi.org/10.1007/s11032-012-9699-6 DO - 10.1007/s11032-012-9699-6 ID - Xu2012 ER - TY - JOUR AU - Riedelsheimer, C. AU - Melchinger, A. E. PY - 2013 DA - 2013// TI - Optimizing the allocation of resources for genomic selection in one breeding cycle JO - Theor Appl Genet VL - 126 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-013-2175-9 DO - 10.1007/s00122-013-2175-9 ID - Riedelsheimer2013 ER - TY - JOUR AU - Pavy, N. AU - Gagnon, F. AU - Rigault, P. AU - Blais, S. AU - Deschênes, A. AU - Boyle, B. AU - Pelgas, B. AU - Deslauriers, M. AU - Clément, S. AU - Lavigne, P. AU - Lamothe, M. AU - Cooke, J. E. K. AU - Jaramillo-Correa, J. P. AU - Beaulieu, J. AU - Isabel, N. AU - Mackay, J. AU - Bousquet, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Development of high-density SNP genotyping arrays for white spruce (Picea glauca) and transferability to subtropical and nordic congeners JO - Mol Ecol Resour VL - 13 UR - https://doi.org/10.1111/1755-0998.12062 DO - 10.1111/1755-0998.12062 ID - Pavy2013 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Crowhurst, R. N. AU - Troggio, M. AU - Davey, M. W. AU - Gilmore, B. AU - Lawley, C. AU - Vanderzande, S. AU - Hellens, R. P. AU - Kumar, S. AU - Cestaro, A. AU - Velasco, R. AU - Main, D. AU - Rees, J. D. AU - Iezzoni, A. AU - Mockler, T. AU - Wilhelm, L. AU - Weg, E. AU - Gardiner, S. E. AU - Bassil, N. AU - Peace, C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Genome-wide SNP detection, validation, and development of an 8K SNP array for apple JO - PLoS ONE VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0031745 DO - 10.1371/journal.pone.0031745 ID - Chagné2012 ER - TY - JOUR AU - Troggio, M. AU - Gleave, A. AU - Salvi, S. AU - Chagné, D. AU - Cestaro, A. AU - Kumar, S. AU - Crowhurst, R. N. AU - Gardiner, S. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Apple, from genome to breeding JO - Tree Genet Genomes VL - 8 UR - https://doi.org/10.1007/s11295-012-0492-9 DO - 10.1007/s11295-012-0492-9 ID - Troggio2012 ER - TY - JOUR AU - Koboldt, D. C. AU - Chen, K. AU - Wylie, T. AU - Larson, D. E. AU - McLellan, M. D. AU - Mardis, E. R. AU - Weinstock, G. M. AU - Wilson, R. K. AU - Ding, L. PY - 2009 DA - 2009// TI - VarScan: variant detection in massively parallel sequencing of individual and pooled samples JO - Bioinformatics VL - 25 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btp373 DO - 10.1093/bioinformatics/btp373 ID - Koboldt2009 ER - TY - JOUR AU - Malik, S. K. AU - Rohini, M. R. AU - Kumar, S. AU - Choudhary, R. AU - Pal, D. AU - Chaudhury, R. PY - 2012 DA - 2012// TI - Assessment of genetic diversity in sweet orange [Citrus sinensis (L.) Osbeck] cultivars of India using morphological and RAPD markers JO - Agric Res VL - 1 UR - https://doi.org/10.1007/s40003-012-0045-3 DO - 10.1007/s40003-012-0045-3 ID - Malik2012 ER - TY - JOUR AU - Xu, Q. AU - Chen, L. -. L. AU - Ruan, X. AU - Chen, D. AU - Zhu, A. AU - Chen, C. AU - Bertrand, D. AU - Jiao, W. -. B. AU - Hao, B. -. H. AU - Lyon, M. P. AU - Chen, J. AU - Gao, S. AU - Xing, F. AU - Lan, H. AU - Chang, J. -. W. AU - Ge, X. AU - Lei, Y. AU - Hu, Q. AU - Miao, Y. AU - Wang, L. AU - Xiao, S. AU - Biswas, M. K. AU - Zeng, W. AU - Guo, F. AU - Cao, H. AU - Yang, X. AU - Xu, X. -. W. AU - Cheng, Y. -. J. AU - Xu, J. AU - Liu, J. -. H. PY - 2013 DA - 2013// TI - The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis) JO - Nat Genet VL - 45 UR - https://doi.org/10.1038/ng.2472 DO - 10.1038/ng.2472 ID - Xu2013 ER - TY - JOUR AU - Chagné, D. AU - Gasic, K. AU - Crowhurst, R. N. AU - Han, Y. AU - Bassett, H. C. AU - Bowatte, D. R. AU - Lawrence, T. J. AU - Rikkerink, E. H. A. AU - Gardiner, S. E. AU - Korban, S. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Development of a set of SNP markers present in expressed genes of the apple JO - Genomics VL - 92 UR - https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2008.07.008 DO - 10.1016/j.ygeno.2008.07.008 ID - Chagné2008 ER - TY - JOUR AU - Chiang, Y. -. C. AU - Tsai, C. -. M. AU - Chen, Y. -. K. H. AU - Lee, S. -. R. AU - Chen, C. -. H. AU - Lin, Y. -. S. AU - Tsai, C. -. C. PY - 2012 DA - 2012// TI - Development and characterization of 20 new polymorphic microsatellite markers from Mangifera indica (Anacardiaceae) JO - Am J Bot VL - 99 UR - https://doi.org/10.3732/ajb.1100443 DO - 10.3732/ajb.1100443 ID - Chiang2012 ER - TY - JOUR AU - Shriner, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Investigating population stratification and admixture using eigenanalysis of dense genotypes JO - Heredity VL - 107 ID - Shriner2011 ER - TY - JOUR AU - Mukherjee, S. K. PY - 1972 DA - 1972// TI - Origin of mango (Mangifera indica) JO - Econ Bot VL - 26 UR - https://doi.org/10.1007/BF02861039 DO - 10.1007/BF02861039 ID - Mukherjee1972 ER - TY - JOUR AU - Evanno, G. AU - Regnaut, S. AU - Goudet, J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: a simulation study JO - Mol Ecol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x DO - 10.1111/j.1365-294X.2005.02553.x ID - Evanno2005 ER - TY - CHAP AU - Singh, S. AU - Bhat, K. V. PY - 2008 DA - 2008// TI - Molecular characterization and analysis of geographical differentiation of Indian mango (Mangifera indica L.) germplasm BT - I International Symposium on Biotechnology of Fruit Species: BIOTECHFRUIT2008 839 ID - Singh2008 ER - TY - JOUR AU - Chang, S. AU - Puryear, J. AU - Cairney, J. PY - 1993 DA - 1993// TI - A simple and efficient method for isolating RNA from pine trees JO - Plant Mol Biol Report VL - 11 UR - https://doi.org/10.1007/BF02670468 DO - 10.1007/BF02670468 ID - Chang1993 ER - TY - JOUR AU - Lambert, J. D. AU - Chan, X. Y. AU - Spiecker, B. AU - Sweet, H. C. PY - 2010 DA - 2010// TI - Characterizing the embryonic transcriptome of the snail Ilyanassa JO - Integr Comp Biol VL - 50 UR - https://doi.org/10.1093/icb/icq121 DO - 10.1093/icb/icq121 ID - Lambert2010 ER - TY - JOUR AU - Chevreux, B. AU - Pfisterer, T. AU - Drescher, B. AU - Driesel, A. J. AU - Muller, W. E. AU - Wetter, T. AU - Suhai, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - Using the miraEST assembler for reliable and automated mRNA transcript assembly and SNP detection in sequenced ESTs JO - Genome Res VL - 14 UR - https://doi.org/10.1101/gr.1917404 DO - 10.1101/gr.1917404 ID - Chevreux2004 ER - TY - JOUR AU - Rice, P. AU - Longden, I. AU - Bleasby, A. PY - 2000 DA - 2000// TI - EMBOSS: the European molecular biology open software suite JO - Trends Genet VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/S0168-9525(00)02024-2 DO - 10.1016/S0168-9525(00)02024-2 ID - Rice2000 ER - TY - JOUR AU - Gotz, S. AU - Garcia-Gomez, J. M. AU - Terol, J. AU - Williams, T. D. AU - Nagaraj, S. H. AU - Nueda, M. J. AU - Robles, M. AU - Talon, M. AU - Dopazo, J. AU - Conesa, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - High-throughput functional annotation and data mining with the Blast2GO suite JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkn176 DO - 10.1093/nar/gkn176 ID - Gotz2008 ER - TY - JOUR AU - Kofler, R. AU - Schlotterer, C. AU - Lelley, T. PY - 2007 DA - 2007// TI - SciRoKo: a new tool for whole genome microsatellite search and investigation JO - Bioinformatics VL - 23 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm157 DO - 10.1093/bioinformatics/btm157 ID - Kofler2007 ER - TY - BOOK AU - Weir, B. S. PY - 1990 DA - 1990// TI - Genetic data analysis. Methods for discrete population genetic data PB - Sinauer Associates, Inc. Publishers CY - Sunderland ID - Weir1990 ER - TY - JOUR AU - Bowcock, A. M. AU - Ruiz-Linares, A. AU - Tomfohrde, J. AU - Minch, E. AU - Kidd, J. R. AU - Cavalli-Sforza, L. L. PY - 1994 DA - 1994// TI - High resolution of human evolutionary trees with polymorphic microsatellites JO - Nature VL - 368 UR - https://doi.org/10.1038/368455a0 DO - 10.1038/368455a0 ID - Bowcock1994 ER - TY - JOUR AU - Odong, T. L. AU - Heerwaarden, J. AU - Jansen, J. AU - Hintum, T. J. AU - Eeuwijk, F. A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Determination of genetic structure of germplasm collections: are traditional hierarchical clustering methods appropriate for molecular marker data? JO - Theor Appl Genet VL - 123 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-011-1576-x DO - 10.1007/s00122-011-1576-x ID - Odong2011 ER - TY - JOUR AU - Paradis, E. AU - Claude, J. AU - Strimmer, K. PY - 2004 DA - 2004// TI - APE: analyses of phylogenetics and evolution in R language JO - Bioinformatics VL - 20 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg412 DO - 10.1093/bioinformatics/btg412 ID - Paradis2004 ER - TY - JOUR AU - Pritchard, J. K. AU - Stephens, M. AU - Donnelly, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - Inference of population structure using multilocus genotype data JO - Genetics VL - 155 ID - Pritchard2000 ER - TY - JOUR AU - Wright, S. PY - 1950 DA - 1950// TI - Genetical structure of populations JO - Nature VL - 166 UR - https://doi.org/10.1038/166247a0 DO - 10.1038/166247a0 ID - Wright1950 ER -