Table 3 Thermocycling conditions for amplification of genes using the PCR

Gene

Protocol

nrITS

1 cycle: 5 min 95 °C

35 cycles: 1 min 94 °C, 1 min52 °C, 1 min 72 °C

1 cycle: 8 min72 °C

matK

1 cycle: 4 min 95 °C

35 cycles: 1 min 94 °C, 1 min50 °C, 1.5 min 72 °C

1 cycle: 10 min72 °C

trnH-psbA

1 cycle: 4 min 95 °C

25 cycles: 1 min 94 °C, 1 min56 °C, 1 min 72 °C

1 cycle: 7 min72 °C