TY - JOUR AU - Borevitz, J. O. AU - Liang, D. AU - Plouffe, D. AU - Chang, H. S. AU - Zhu, T. AU - Weigel, D. AU - Berry, C. C. AU - Winzeler, E. AU - Chory, J. PY - 2003 DA - 2003// TI - Large-scale identification of single-feature polymorphisms in complex genomes JO - Genome Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1101/gr.541303 DO - 10.1101/gr.541303 ID - Borevitz2003 ER - TY - JOUR AU - Cui, X. AU - Xu, J. AU - Asghar, R. AU - Condamine, P. AU - Svensson, J. T. AU - Wanamaker, S. AU - Stein, N. AU - Roose, M. AU - Close, T. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Detecting single-feature polymorphisms using oligonucleotide arrays and robustified projection pursuit JO - Bioinformatics VL - 21 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti640 DO - 10.1093/bioinformatics/bti640 ID - Cui2005 ER - TY - JOUR AU - Walia, H. AU - Wilson, C. AU - Condamine, P. AU - Liu, X. AU - Ismail, A. M. AU - Zeng, L. H. AU - Wanamaker, S. I. AU - Mandal, J. AU - Xu, J. AU - Cui, X. P. AU - Close, T. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Comparative transcriptional profiling of two contrasting rice genotypes under salinity stress during the vegetative growth stage JO - Plant Physiol VL - 139 UR - https://doi.org/10.1104/pp.105.065961 DO - 10.1104/pp.105.065961 ID - Walia2005 ER - TY - JOUR AU - Winzeler, E. A. AU - Richards, D. R. AU - Conway, A. R. AU - Goldstein, A. L. AU - Kalman, S. AU - McCullough, M. J. AU - McCusker, J. H. AU - Stevens, D. A. AU - Wodicka, L. AU - Lockhart, D. J. AU - Davis, R. W. PY - 1998 DA - 1998// TI - Direct allelic variation scanning of the yeast genome JO - Science VL - 281 UR - https://doi.org/10.1126/science.281.5380.1194 DO - 10.1126/science.281.5380.1194 ID - Winzeler1998 ER - TY - JOUR AU - Ronald, J. AU - Akey, J. M. AU - Whittle, J. AU - Smith, E. N. AU - Yvert, G. AU - Kruglyak, L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Simultaneous genotyping, gene-expression measurement, and detection of allele-specific expression with oligonucleotide arrays JO - Genome Res VL - 15 UR - https://doi.org/10.1101/gr.2850605 DO - 10.1101/gr.2850605 ID - Ronald2005 ER - TY - JOUR AU - Kumar, R. AU - Qiu, J. AU - Joshi, T. AU - Valliyodan, B. AU - Xu, D. AU - Nguyen, H. T. PY - 2007 DA - 2007// TI - Single feature polymorphism discovery in rice JO - PLoS ONE VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0000284 DO - 10.1371/journal.pone.0000284 ID - Kumar2007 ER - TY - JOUR AU - Edwards, J. D. AU - Janda, J. AU - Sweeney, M. T. AU - Gaikwad, A. B. AU - Liu, B. AU - Leung, H. AU - Galbraith, D. W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Development and evaluation of a high-throughput, low-cost genotyping platform based on oligonucleotide microarrays in rice JO - Plant Methods VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1746-4811-4-13 DO - 10.1186/1746-4811-4-13 ID - Edwards2008 ER - TY - JOUR AU - Bonilla, P. AU - Dvorak, J. AU - Mackill, D. AU - Deal, K. AU - Gregorio, G. PY - 2002 DA - 2002// TI - RFLP and SSLP mapping of salinity tolerance genes in chromosome 1 of rice (Oryza sativaL.) using recombinant inbred lines JO - Philipp Agric Scientist VL - 85 ID - Bonilla2002 ER - TY - CHAP AU - Gregorio, G. B. AU - Senadhira, D. AU - Mendoza, R. D. PY - 1997 DA - 1997// TI - Screening rice for salinity tolerance BT - IRRI Discussion Paper Series Number 22 PB - International Rice Research Institute CY - Manila, Philippines ID - Gregorio1997 ER - TY - JOUR AU - Gregorio, G. B. AU - Senadhira, D. AU - Mendoza, R. D. AU - Manigbas, N. L. AU - Roxas, J. P. AU - Guerta, C. Q. PY - 2002 DA - 2002// TI - Progress in breeding for salinity tolerance and associated abiotic stresses in rice JO - Field Crops Res VL - 76 UR - https://doi.org/10.1016/S0378-4290(02)00031-X DO - 10.1016/S0378-4290(02)00031-X ID - Gregorio2002 ER - TY - JOUR AU - Lin, H. X. AU - Zhu, M. Z. AU - Yano, M. AU - Gao, J. P. AU - Liang, Z. W. AU - Su, W. A. AU - Hu, X. H. AU - Ren, Z. H. AU - Chao, D. Y. PY - 2004 DA - 2004// TI - QTLs for Na+ and K+uptake of the shoots and roots controlling rice salt tolerance JO - Theor Appl Genet VL - 108 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-003-1421-y DO - 10.1007/s00122-003-1421-y ID - Lin2004 ER - TY - JOUR AU - Ren, Z. H. AU - Gao, J. P. AU - Li, L. G. AU - Cai, X. L. AU - Huang, W. AU - Chao, D. Y. AU - Zhu, M. Z. AU - Wang, Z. Y. AU - Luan, S. AU - Lin, H. X. PY - 2005 DA - 2005// TI - A rice quantitative trait locus for salt tolerance encodes a sodium transporter JO - Nat Genet VL - 37 UR - https://doi.org/10.1038/ng1643 DO - 10.1038/ng1643 ID - Ren2005 ER - TY - JOUR AU - Rostoks, N. AU - Borevitz, J. O. AU - Hedley, P. E. AU - Russell, J. AU - Mudie, S. AU - Morris, J. AU - Cardle, L. AU - Marshall, D. F. AU - Waugh, R. PY - 2005 DA - 2005// TI - Single-feature polymorphism discovery in the barley transcriptome JO - Genome Biol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2005-6-6-r54 DO - 10.1186/gb-2005-6-6-r54 ID - Rostoks2005 ER - TY - JOUR AU - Mcnally, K. L. AU - Bruskiewich, R. AU - Mackill, D. AU - Buell, C. R. AU - Leach, J. E. AU - Leung, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Sequencing multiple and diverse rice varieties. Connecting whole-genome variation with phenotypes JO - Plant Physiol VL - 141 UR - https://doi.org/10.1104/pp.106.077313 DO - 10.1104/pp.106.077313 ID - Mcnally2006 ER - TY - STD TI - HarvEST: Affymetrix Rice version 1.01. [web version: http://www.harvest-web.org; download from: http://harvest.ucr.edu/]. UR - http://harvest.ucr.edu/ ID - ref15 ER - TY - CHAP AU - Rozen, S. AU - Skaletsky, H. J. ED - Krawetz, S. ED - Misener, S. PY - 2000 DA - 2000// TI - Primer3 on the WWW for general users and for biologist programmers BT - Bioinformatics Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology) PB - Humana Press CY - Totowa, NJ ID - Rozen2000 ER - TY - JOUR AU - Sanger, F. AU - Nicklen, S. AU - Coulson, A. R. PY - 1977 DA - 1977// TI - DNA sequencing with chain terminating inhibitors JO - Proc Natl Acad Sci USA VL - 74 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.74.12.5463 DO - 10.1073/pnas.74.12.5463 ID - Sanger1977 ER - TY - JOUR AU - Nicholas, K. B. AU - Nicholas, H. B. J. AU - Deerfield, D. W. PY - 1997 DA - 1997// TI - GeneDoc: analysis and visualization of genetic variation JO - EMBNEW NEWS VL - 4 ID - Nicholas1997 ER -