SSR motif | Number of repeat units | Total | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | 13 | 14 | 15 | ≥16 |  |
AC | - | Â | 3 | 1 | Â | Â | 2 | Â | 1 | Â | Â | Â | 7 |
AG | - | 7 | 50 | 20 | 12 | 7 | 8 | 4 | 1 | 3 | 1 | 1 | 114 |
AT | - | 14 | 83 | 32 | 22 | 13 | 11 | 1 | 4 | 2 | 2 | 11 | 195 |
CG | - | Â | 9 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 9 |
CT | - | 23 | 66 | 46 | 15 | 21 | 12 | 14 | 8 | 5 | 7 | 5 | 222 |
GT | - | 4 | 10 | 6 | 4 | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | 1 | 27 |
AAC | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
AAG | 7 | 5 | 21 | 7 | 4 | 2 | 2 | 1 | Â | Â | Â | Â | 49 |
AAT | 3 | 2 | 2 | 3 | 1 | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | 12 |
ACC | 1 | 2 | 4 | 1 | 2 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 11 |
ACG | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0 |
ACT | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0 |
AGC | 6 | 5 | 6 | 1 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 19 |
AGG | 3 | 1 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 7 |
AGT | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0 |
ATC | 4 | 3 | 3 | 7 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 18 |
ATG | 4 | 2 | 8 | 4 | 1 | 1 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | 21 |
ATT | 11 | 3 | 11 | 1 | 5 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 32 |
CCG | 1 | Â | 2 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 4 |
CCT | 1 | 1 | 2 | 5 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 10 |
CGG | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |
CGT | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 0 |
CTG | 2 | 2 | 3 | 1 | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 9 |
CTT | 8 | 6 | 15 | 3 | 10 | Â | 2 | 1 | Â | Â | Â | Â | 45 |
GGT | 3 | 1 | 6 | 3 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 13 |
GTT | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
AAAG | Â | 2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |
TTAT | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
TTTC | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
TCTT | Â | Â | Â | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
AAAGA | Â | Â | Â | 1 | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 2 |
TTTTG | 1 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | 1 |
 |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 836 |