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Table 2 Genetic analysis of parentals and haploid, double haploid and aneuploid plants of 'Clemenules' with SSR markers.

From: Recovery and characterization of a Citrus clementinaHort. ex Tan. 'Clemenules' haploid plant selected to establish the reference whole Citrus genome sequence

Marker

Linkage group

Parental

Haploid

D. haploid

Aneuploid

  

Clemenules

Fortune

G

C.1

B.1

  

a1

a2

a1

a2

a1

a2

a1

a2

a1

a2

Ci02A09

 

161

162

161

162

 

162

 

162

161

162

Ci02B07

 

162

164

162

164

162

 

162

 

162

164

Ci02G12

  

250

220

250

 

250

 

250

 

250

Ci07A12

 

170

 

170

178

170

 

170

 

170

 

Mest 056

 

155

165

155

165

 

165

 

165

155

165

Mest 088

 

134

138

134

  

138

 

138

134

 

Mest 402

 

120

125

120

150

120

  

125

120

125

Mest 419

 

118

135

 

135

118

  

135

118

 

Mest 431

 

260

270

 

270

260

  

270

260

270

Mest 458

 

215

225

 

225

215

  

225

215

225

Mest 473

 

216

224

 

224

 

224

 

224

216

224

Mest 488

 

136

146

146

156

 

146

 

146

136

146

Mest 506

 

164

168

164

  

168

 

168

164

 

Mest 525

 

170

180

170

180

170

  

180

 

180

TAA 1

 

160

165

160

165

 

165

 

165

160

165

Ci02D09

1

229

237

229

237

 

237

229

 

229

237

Ci03C08

1

210

226

 

226

 

226

210

 

210

226

Ci05A05

1

146

154

146

164

146

  

154

 

154

Ci06B07

1

106

108

106

108

 

108

106

 

106

 

CAC 15

1

150

159

150

159

150

  

159

150

159

TAA 41

1

148

154

137

148

148

  

154

 

154

Ci02C09

2

250

256

250

256

 

256

 

256

250

256

Ci02G02

2

113

123

113

123

 

123

 

123

113

 

Mest 086

2

130

140

 

140

 

140

130

  

140

Mest 112

2

439

460

439

  

460

439

 

439

 

Ci06B05

3

204

230

230

236

204

  

230

204

230

Mest 001

3

170

165

165

 

170

 

170

 

170

 

Mest 246

3

248

256

248

256

248

  

256

248

 

TAA 15

3

184

188

188

198

184

  

188

184

188

Mest 131

4

160

170

160

 

160

 

160

  

170

Mest 164

4

187

197

187

197

 

197

187

 

187

197

Mest 256

4

208

220

 

220

 

220

208

 

208

220

Mest 369

4

161

165

165

189

 

165

161

 

161

165

Mest 370

4

187

195

187

195

187

 

187

 

187

195

CAC 23

4

245

250

245

250

245

  

250

245

250

Ci02D04b

5

198

208

198

208

 

208

198

 

198

208

Ci03D12a

5

246

256

 

256

246

  

256

246

256

Ci07D06

5

155

175

155

175

 

175

155

 

155

175

Ci03B07

6

263

265

263

276

 

265

263

 

263

 

Ci07C07

6

224

238

238

 

224

  

238

 

238

Mest 107

6

178

188

178

 

178

 

178

 

178

188

Ci02E08

7

260

275

260

275

260

 

260

 

260

275

Ci06A12

7

96

102

96

102

96

  

102

96

102

Ci07E12

7

120

126

120

126

120

  

126

 

126

Mest 015

7

184

188

184

188

 

188

184

 

184

188

Mest 154

7

105

108

105

108

105

  

108

105

108

Ci02F12

8

126

134

126

 

126

 

126

 

126

134

Mest 123

8

268

296

268

296

268

 

268

 

268

296

Mest 132

8

225

250

225

230

225

 

225

 

225

250

Ci07C09

9

246

260

246

 

248

  

260

246

 

Ci08C05

9

151

173

155

173

 

173

151

  

173

Mest 291

9

178

190

178

186

 

190

 

190

178

190

  1. Numbers indicate the size in nucleotids (nt) of the two alleles for each SSR marker.
  2. Numbers in bold corresponds to specific alleles of 'Fortune'mandarin.