Table 2 Minimum rearrangements via inversions in pairwise comparisons of seven chloroplast genomes
comparison species | large inversion* | one gene inversion** | loss of a large IR | total inversion |
|---|---|---|---|---|
C. japonica vs P. thunbergii | 11 | 4 | - | 15 |
C. japonica vs C. taitungensis | 8 | 4 | 1 | 13 |
C. japonica vs A. capillus | 16 | 4 | 1 | 21 |
C. japonica vs M. polymorpha | 12 | 3 | 1 | 16 |
C. japonica vs E. globulus | 12 | 4 | 1 | 17 |
C. japonica vs O. sativa | 16 | 3 | 1 | 20 |
P. thunbergii vs C. taitungensis | 6 | 1 | 1 | 8 |
P. thunbergii vs A. capillus | 13 | 2 | 1 | 16 |
P. thunbergii vs M. polymorpha | 7 | 1 | 1 | 9 |
P. thunbergii vs E. globulus | 8 | 2 | 1 | 11 |
P. thunbergii vs O. sativa | 12 | 1 | 1 | 14 |
C. taitungensis vs A. capillus | 9 | 1 | - | 10 |
C. taitungensis vs M. polymorpha | 3 | 0 | - | 3 |
C. taitungensis vs E. globulus | 4 | 1 | - | 5 |
C. taitungensis vs O. sativa | 8 | 0 | - | 8 |
A. capillus vs M. polymorpha | 8 | 1 | - | 9 |
A. capillus vs E. globulus | 9 | 2 | - | 11 |
A. capillus vs O. sativa | 13 | 1 | - | 14 |
M. polymorpha vs E. globulus | 3 | 1 | - | 4 |
M. polymorpha vs O. sativa | 7 | 0 | - | 7 |
E. globulus vs O. sativa | 4 | 1 | - | 5 |