Skip to main content

Table 2 Allele frequency database, expected heterozigosity (He), observed heterozygosity (Ho) and polymorphic information content (PIC) estimates for a random set of 25 microsatellite markers analyzed with a sample of 40 C. melo accessions.

From: Development of microsatellite markers from an enriched genomic library for genetic analysis of melon (Cucumis meloL.)

Locus

Allele (bp)

Frequency

He

Ho

PIC

Locus

Allele (bp)

Frequency

He

Ho

PIC

CMBR1

140

0.03

0.53

0.27

0.47

CMBR33

180

0.15

0.65

0.22

0.57

 

150

0.20

    

150

0.03

   
 

160

0.12

    

160

0.39

   
 

130

0.65

   

CMBR39

150

0.03

0.60

0.00

0.52

CMBR100

110

0.10

0.45

0.10

0.42

 

160

0.03

   
 

130

0.05

    

190

0.03

   
 

140

0.13

    

170

0.49

   
 

120

0.73

    

165

0.03

   

CMBR107

170

0.53

0.51

0.18

0.37

 

180

0.41

   
 

180

0.47

   

CMBR42

110

0.11

0.44

0.00

0.40

CMBR108

160

0.03

0.30

0.06

0.28

 

150

0.14

   
 

200

0.03

    

160

0.73

   
 

170

0.11

    

100

0.03

   
 

180

0.83

   

CMBR43

230

0.08

0.68

0.22

0.65

CMBR14

130

0.39

0.53

0.39

0.42

 

280

0.03

   
 

140

0.04

    

240

0.25

   
 

150

0.57

    

290

0.15

   

CMBR18

160

0.03

0.33

0.06

0.29

 

250

0.49

   
 

170

0.17

   

CMBR44

100

0.35

0.46

0.13

0.35

 

150

0.81

    

110

0.65

   

CMBR19

180

0.05

0.48

0.08

0.44

CMBR5

170

0.58

0.49

0.40

0.37

 

150

0.01

    

180

0.43

   
 

160

0.05

   

CMBR56

180

0.01

0.36

0.08

0.31

 

110

0.18

    

210

0.03

   
 

170

0.70

    

170

0.18

   

CMBR20

150

0.08

0.50

0.05

0.46

 

150

0.78

   
 

180

0.01

   

CMBR64

130

0.05

0.53

0.06

0.48

 

140

0.01

    

140

0.16

   
 

110

0.15

    

150

0.13

   
 

160

0.69

    

160

0.66

   
 

170

0.05

   

CMBR7

90

0.10

0.54

0.46

0.49

CMBR22

170

0.23

0.59

0.15

0.52

 

80

0.06

   
 

160

0.04

    

100

0.19

   
 

150

0.14

    

110

0.64

   
 

180

0.59

   

CMBR70

200

0.15

0.46

0.00

0.41

CMBR24

160

0.23

0.55

0.11

0.49

 

150

0.10

   
 

140

0.03

    

190

0.03

   
 

170

0.12

   

CMBR71

100

0.65

0.46

0.05

0.35

 

180

0.62

    

110

0.35

   

CMBR25

150

0.12

0.70

0.08

0.63

CMBR73

110

0.19

0.61

0.50

0.53

 

160

0.13

    

100

0.28

   
 

170

0.39

    

120

0.54

   
 

180

0.36

   

CMBR89

120

0.06

0.63

0.00

0.56

CMBR27

240

0.01

0.55

0.40

0.45

 

130

0.51

   
 

260

0.05

    

150

0.11

   
 

250

0.38

    

140

0.31

   

270

0.56