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Table 3 Screening amiRNA-expressed transgenic potato lines

From: Reduced polyphenol oxidase gene expression and enzymatic browning in potato (Solanum tuberosum L.) with artificial microRNAs

Transgenic line Kan Insert Relative expression level of target gene amiRNA
POTP1/P2 POT32 POT33 POT72
amiRPPO1-2 + + 0.02 ± 0     +
amiRPPO1-3 + + 0.06 ± 0     +
amiRPPO1-7 + + 0.14 ± 0     +
amiRPPO1-8 + + 0.03 ± 0     n.t.
amiRPPO1-9 + + 0.15 ± 0.01     n.t.
amiRPPO1-10 + n.t. n.t.     n.t.
amiRPPO1-12 + + 0.34 ± 0     +
amiRPPO1-13 + n.t. n.t.     n.t.
WT - - 0.99 ± 0.08     -
amiRPPO2-1 + n.t.   n.t.    -
amiRPPO2-4 + n.t.   1.42 ± 0.12    -
amiRPPO2-9 + +   n.t.    -
amiRPPO2-12 + +   1.03 ± 0.02    -
amiRPPO2-13 + n.t.   n.t.    -
amiRPPO2-15 + n.t.   0.83 ± 0.11    -
amiRPPO2-16 + +   0.45 ± 0.03    -
amiRPPO2-17 + n.t.   n.t.    -
amiRPPO2-18 + +   1.07 ± 0.04    -
amiRPPO2-19 + +   0.99 ± 0.03    -
WT - -   1.00 ± 0.01    -
amiRPPO3-8 + +    1.29 ± 0.23   +
amiRPPO3-9 + n.t.    n.t.   n.t.
amiRPPO3-12 + +    0.66 ± 0.12   +
amiRPPO3-13 + n.t.    0.97 ± 0.17   n.t.
amiRPPO3-14 + +    n.t.   n.t.
amiRPPO3-15 + +    n.v.   +
amiRPPO3-16 + n.t.    1.31 ± 0.40   n.t.
amiRPPO3-17 + +    n.t.   n.t.
amiRPPO3-18 + +    n.t.   n.t.
WT - -    1.00 ± 0   -
amiRPPO23-3 + +   n.t. n.t.   n.t.
amiRPPO23-4 + n.t.   1.03 ± 0.11 1.28 ± 0.29   n.t.
amiRPPO23-5 + +   0.32 ± 0.01 0.44 ± 0.08   +
amiRPPO23-7 + +   0.28 ± 0.03 0.19 ± 0.01   +
amiRPPO23-8 + +   0.42 ± 0 0.01 ± 0   +
amiRPPO23-9 + +   0.07 ± 0.01 0.01 ± 0   +
amiRPPO23-14 + n.t.   n.t. n.t.   n.t.
amiRPPO23-15 + n.t.   0.23 ± 0.07 0.00 ± 0   n.t.
amiRPPO23-16 + n.t.   n.t. n.t.   n.t.
WT - -   1.00 ± 0.08 1.00 ± 0.12   -
amiRPPO234-3 + n.t.   n.t. n.t. n.t. -
amiRPPO234-4 + n.t.   n.t. n.t. n.t. -
amiRPPO234-5 + +   0.87 ± 0.06 0.92 ± 0.14 1.03 ± 0.17 -
amiRPPO234-6 + n.t.   0.98 ± 0.12 3.39 ± 0.47 1.50 ± 0.08 -
amiRPPO234-7 + +   1.22 ± 0.16 1.16 ± 0.09 1.04 ± 0.17 -
amiRPPO234-8 + +   1.66 ± 0.02 0.71 ± 0.04 0.69 ± 0.02 -
amiRPPO234-9 + +   0.47 ± 0.04 0.40 ± 0.09 0.50 ± 0.13 -
amiRPPO234-10 + +   0.61 ± 0.03 0.61 ± 0.09 0.54 ± 0.21 -
amiRPPO234-11 + n.t.   1.35 ± 0.16 0.83 ± 0.17 1.16 ± 0.13 -
amiRPPO234-13 + n.t.   n.t. n.t. n.t. -
WT - -   1.00 ± 0.01 1.00 ± 0.08 1.00 ± 0.01 -
amiRPPO234A-2 + n.t.   1.09 ± 0.20 1.53 ± 0.19 1.26 ± 0.13 n.t.
amiRPPO234A-4 + +   0.34 ± 0.05 0.43 ± 0.07 0.04 ± 0.01 +
amiRPPO234A-6 + +   0.09 ± 0.01 0.02 ± 0 0.05 ± 0.01 +
amiRPPO234A-10 + +   1.07 ± 0.03 0.77 ± 0.25 0.47 ± 0.02 +
amiRPPO234A-13 + +   n.t. n.t. n.t. n.t.
amiRPPO234A-14 + +   0.58 ± 0 0.22 ± 0.01 0.15 ± 0.03 +
amiRPPO234A-15 + n.t.   1.25 ± 0.18 0.8 ± 0.12 1.34 ± 0.16 n.t.
amiRPPO234A-16 + n.t.   0.83 ± 0.12 1.21 ± 0.09 0.60 ± 0.07 n.t.
WT - -   0.99 ± 0.08 1.01 ± 0.18 0.99 ± 0.05 -
amiRPPO1234-1 + n.t. n.t. n.t. n.t. n.t. n.t.
amiRPPO1234-2 + + 0.52 ± 0.07 0.30 ± 0.03 0.46 ± 0.01 0.34 ± 0.08 +
amiRPPO1234-3 + + 0.43 ± 0.04 0.19 ± 0.06 0.07 ± 0 0.43 ± 0.1 n.t.
amiRPPO1234-6 + + 0.27 ± 0.03 0.20 ± 0.04 0.19 ± 0 0.2 ± 0.04 +
amiRPPO1234-7 + n.t. n.t. n.t. n.t. n.t. n.t.
amiRPPO1234-8 + n.t. n.t. n.t. n.t. n.t. n.t.
amiRPPO1234-9 + + n.t. n.t. n.t. n.t. n.t.
amiRPPO1234-11 + n.t. 0.15 ± 0.01 0.34 ± 0.11 1.85 ± 0.17 0.08 ± 0.01 n.t.
amiRPPO1234-12 + + 0.28 ± 0.03 0.66 ± 0.02 0.47 ± 0.03 0.18 ± 0.01 +
amiRPPO1234-16 + n.t. 0.42 ± 0.03 0.14 ± 0.03 0.15 ± 0 0.08 ± 0.06 n.t.
WT - - 1.00 ± 0.09 1.00 ± 0.1 1.00 ± 0.19 1.00 ± 0.07 -
  1. Note: Kan, is selection of transgenic lines with Kanamycin (100 mg/L); +, Kanamycin resistant; −, Kanamycin susceptible (such as for WT). Insert, is transgene insertion into the chromosome(s) detected by PCR; +, positive in PCR detection; −, negative in PCR detection; n.t., not test. Relative expression level of target gene, was assayed using in vitro cultured potato leaf and stem tissues by qRT-PCR; the data is the average of three technical repeats and their standard deviation of using one original sample from each transgenic line; n.v., no value; n.t. not test. amiRNA, is detection of mature amiRNAs by RT-PCR; +, detectable (positive); −, not detectable (negative); n.t., not test.