Skip to main content

Table 2 Summary of tissue/organ expression profiling by SemiQ RT-PCR

From: Characterization of the glutathione S-transferase gene family through ESTs and expression analyses within common and pigmented cultivars of Citrus sinensis(L.) Osbeck

GST Class Sequence ID Cultivar SemiQ RT-PCR
    Albedo Flavedo Flesh Young leaf Adult leaf Ovary
Tau CITSI24:CX077363 C + + ++ +++a ++++a* ++++a*
M + + +++ ++a ++a* ++a*
CITSI47:3 C ++ ++ ++ ++a ++ +++b*
M +a ++ + ++a ++ -*
CITSI57:1 C ++a +a +++a ++a ++++a ++++a*
M ++a ++a ++++a ++a +++a -*
CITSI43:1 C ++ ++ +++ +++ +++ ++++a*
M ++ ++ +++ +++ +++ ++*
CITSI16:1 C +++ - +++ +++ +++ -
M +++ - ++ +++ +++ -
CITSI53:1 C +++ +++ +++ +++ +++ +++a
M +++ +++ +++ +++ +++ +++
CITSI41:1 C + ++ +++ ++a +++a +++a
M + ++ +++ ++a ++ ++
CITSI25:1 C ++ + + +++ ++ +
M + + ++ +++ ++ ++
CITSI51:1 C ++ ++ ++ - ++ ++b*
M + ++ ++ - ++ -*
CITSI04:1 C - - - - ++ -
M - - - - + -
CITSI44:1 C ++ ++ +++ ++ +++ ++b*
M +++ +++ ++ +++ +++ -*
CITSI36:1 C ++ ++ +++ ++++ +++ +++a
M +++ ++ +++ ++++ +++ ++
Phi CITSI52:1 C + + + ++ ++ +
M - + + ++ ++ +
CITSI38:CK934228 C - + ++* ++ +++ +
M - + -* ++ ++ -
CITSI23:1 C - + ++ ++ ++ +
M - + + ++ ++ -
CITSI34:CK939385 C - + - ++ +++* +
M - + - + +* -
CITSI33:1 C +++ ++ +++ +++ ++ +++
M +++ ++ ++ +++ +++ ++
CITSI05:DY257328 C ++ ++ ++ ++ ++a ++
M ++ ++ ++ ++ ++ +
CITSI11:1 C + - ++ - + ++
M + + ++ + + +
DQ198153 C - - +* + + -
M - + ++++* + + -
CITSI29:1 C - - + ++ +++ +
M - - + ++ ++ +
CITSI18:1 C - - - - + +
M - - - - - -
Lambda CITSI46:1 C +++ +++ ++++ ++ ++++ ++++
M +++ +++ ++++ +++ ++++ +++
Zeta CITSI21:1 C ++a +a +++a ++a ++a ++a
M ++a ++a +++a ++a ++a ++a
Mapeg CITSI20:1 C ++ ++ +* ++ +++ +++
   M +++ ++ +++* +++ +++ ++
  1. ‘C’ and ‘M’ indicate the Cadenera and Moro cultivars, respectively. Expression level is indicated as '–' (no expression) or from '+' (weak) to '++++' (strong) depending on the presence of the amplicon at the PCR cycle 20 (+), 25 (++), 30 (+++) and 35 (++++).
  2. Uppercase letters indicate:
  3. athe presence of multiple-bands.
  4. bRT-PCR products with size greater than the expected on the basis of the primer design on the transcripts.
  5. *differences in the expression levels of more than ten cycles between the two cultivars.