TY - JOUR AU - Nedergaard, J. AU - Ricquier, D. AU - Kozak, L. P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Uncoupling proteins: current status and therapeutic prospects JO - EMBO Rep VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/sj.embor.7400532 DO - 10.1038/sj.embor.7400532 ID - Nedergaard2005 ER - TY - JOUR AU - Krauss, S. AU - Zhang, C. Y. AU - Lowell, B. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - The mitochondrial uncoupling-protein homologues JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/nrm1592 DO - 10.1038/nrm1592 ID - Krauss2005 ER - TY - JOUR AU - Andrews, Z. B. AU - Diano, S. AU - Horvath, T. L. PY - 2005 DA - 2005// TI - Mitochondrial uncoupling proteins in the CNS: in support of function and survival JO - Nat Rev Neurosci VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/nrn1767 DO - 10.1038/nrn1767 ID - Andrews2005 ER - TY - JOUR AU - Kajimura, S. AU - Seale, P. AU - Spiegelman, B. M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Transcriptional control of brown fat development JO - Cell Metab VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/j.cmet.2010.03.005 DO - 10.1016/j.cmet.2010.03.005 ID - Kajimura2010 ER - TY - JOUR AU - Vercesi, A. E. AU - Martins, L. S. AU - Silva, M. A. P. AU - Leite, H. M. F. AU - Cuccovia, I. M. AU - Chaimovich, H. PY - 1995 DA - 1995// TI - PUMPing plants JO - Nature VL - 375 UR - https://doi.org/10.1038/375024a0 DO - 10.1038/375024a0 ID - Vercesi1995 ER - TY - JOUR AU - Maia, I. G. AU - Benedetti, C. E. AU - Leite, A. AU - Turcinelli, S. R. AU - Vercesi, A. E. AU - Arruda, P. PY - 1998 DA - 1998// TI - AtPUMP: an Arabidopsis gene encoding a plant uncoupling mitochondrial protein JO - FEBS Lett VL - 429 UR - https://doi.org/10.1016/S0014-5793(98)00634-6 DO - 10.1016/S0014-5793(98)00634-6 ID - Maia1998 ER - TY - JOUR AU - Borecky, J. AU - Nogueira, F. T. S. AU - Oliveira, K. A. P. AU - Maia, I. G. AU - Vercesi, A. E. AU - Arruda, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - The plant energy-dissipating mitochondrial systems: depicting the genomic structure and the expression profiles of the gene families of uncoupling protein and alternative oxidase in monocots and dicots JO - J Exp Bot VL - 57 UR - https://doi.org/10.1093/jxb/erj070 DO - 10.1093/jxb/erj070 ID - Borecky2006 ER - TY - JOUR AU - Vercesi, A. E. AU - Borecký, J. AU - Maia, I. G. AU - Arruda, P. AU - Cuccovia, I. M. AU - Chaimovich, H. PY - 2006 DA - 2006// TI - Plant uncoupling mitochondrial proteins JO - Annu Rev Plant Biol VL - 57 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.arplant.57.032905.105335 DO - 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105335 ID - Vercesi2006 ER - TY - JOUR AU - Ito-Inaba, Y. AU - Hida, Y. AU - Mora, H. AU - Inaba, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Molecular identity of uncoupling proteins in thermogenic skunk cabbage JO - Plant Cell Physiol VL - 49 UR - https://doi.org/10.1093/pcp/pcn161 DO - 10.1093/pcp/pcn161 ID - Ito-Inaba2008 ER - TY - JOUR AU - Jezek, P. AU - Borecký, J. AU - Zácková, M. AU - Costa, A. D. AU - Arruda, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Possible basic and specific functions of plant mitochondrial uncoupling protein (pUCP) JO - Biosci Rep VL - 21 UR - https://doi.org/10.1023/A:1013660611154 DO - 10.1023/A:1013660611154 ID - Jezek2001 ER - TY - JOUR AU - Brandalise, M. AU - Maia, I. G. AU - Borecký, J. AU - Vercesi, A. E. AU - Arruda, P. PY - 2003 DA - 2003// TI - Overexpression of plant mitochondrial uncoupling protein in transgenic tobacco increases tolerance to oxidative stress JO - J Bioenerg Biomembr VL - 35 UR - https://doi.org/10.1023/A:1024603530043 DO - 10.1023/A:1024603530043 ID - Brandalise2003 ER - TY - JOUR AU - Begcy, K. AU - Mariano, E. D. AU - Mattiello, L. AU - Nunes, A. V. AU - Mazzafera, P. AU - Maia, I. G. AU - Menossi, M. PY - 2011 DA - 2011// TI - An Arabidopsis mitochondrial uncoupling protein confers tolerance to draught and salt stress in transgenic tobacco plants JO - Plos One VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0023776 DO - 10.1371/journal.pone.0023776 ID - Begcy2011 ER - TY - JOUR AU - Chen, S. AU - Liu, A. AU - Zhang, S. AU - Li, C. AU - Chang, R. AU - Liu, D. AU - Ahammed, G. J. AU - Lin, X. PY - 2013 DA - 2013// TI - Overexpression of mitochondrial uncoupling protein conferred resistance to heat stress an Botrytis cinerea infection in tomato JO - Plant Physiol Biochem VL - 73 UR - https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2013.10.002 DO - 10.1016/j.plaphy.2013.10.002 ID - Chen2013 ER - TY - JOUR AU - Sweetlove, L. J. AU - Lytovchenko, A. AU - Morgan, M. AU - Nunes-Nesi, A. AU - Taylor, N. L. AU - Baxter, C. J. AU - Eickmeier, A. AU - Fernie, A. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Mitochondrial uncoupling protein is required for efficient photosynthesis JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0607751103 DO - 10.1073/pnas.0607751103 ID - Sweetlove2006 ER - TY - JOUR AU - Rhoads, D. M. AU - Umbach, A. L. AU - Subbaiah, C. C. AU - Siedow, J. N. PY - 2006 DA - 2006// TI - Mitochondrial reactive oxygen species: contribution to oxidative stress and interorganellar signaling JO - Plant Physiol VL - 141 UR - https://doi.org/10.1104/pp.106.079129 DO - 10.1104/pp.106.079129 ID - Rhoads2006 ER - TY - JOUR AU - Rhoads, D. M. AU - Subbaiah, C. C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mitochondrial retrograde regulation in plants JO - Mitochondrion VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/j.mito.2007.01.002 DO - 10.1016/j.mito.2007.01.002 ID - Rhoads2007 ER - TY - JOUR AU - Woodson, J. D. AU - Chory, J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Coordination of gene expression between organellar and nuclear genomes JO - Nat Rev Genet VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/nrg2348 DO - 10.1038/nrg2348 ID - Woodson2008 ER - TY - JOUR AU - Ryan, M. T. AU - Hoogenrad, M. J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mitochondrial-nuclear communications JO - Annu Rev Biochem VL - 76 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.biochem.76.052305.091720 DO - 10.1146/annurev.biochem.76.052305.091720 ID - Ryan2007 ER - TY - JOUR AU - Pesaresi, P. AU - Schneider, A. AU - Kleine, T. AU - Leister, D. PY - 2007 DA - 2007// TI - Interorganellar communication JO - Curr Opin Plant Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/j.pbi.2007.07.007 DO - 10.1016/j.pbi.2007.07.007 ID - Pesaresi2007 ER - TY - JOUR AU - Jung, H. S. AU - Chory, J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Signaling between chloroplasts and the nucleus: can a systems biology approach bring clarity to a complex and highly regulated pathway JO - Plant Physiol VL - 152 UR - https://doi.org/10.1104/pp.109.149070 DO - 10.1104/pp.109.149070 ID - Jung2009 ER - TY - JOUR AU - Welchen, E. AU - Garcia, L. AU - Mansilla, N. AU - Gonzalez, D. H. PY - 2013 DA - 2013// TI - Coordination of plant mitochondrial biogenesis: keeping pace with cellular requirements JO - Front Plant Sci VL - 4 ID - Welchen2013 ER - TY - JOUR AU - Zabaleta, E. AU - Heiser, V. AU - Grohmann, L. AU - Brennicke, A. PY - 1998 DA - 1998// TI - Promoters of nuclear-encoded respiratory chain complex I genes from Arabidopsis thaliana contain a region essential for anther/pollen-specific expression JO - Plant J VL - 156 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1998.00177.x DO - 10.1046/j.1365-313X.1998.00177.x ID - Zabaleta1998 ER - TY - JOUR AU - Binder, S. AU - Brennicke, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - Gene expression in plant mitochondria: transcriptional and post-transcriptional control JO - Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci VL - 3586 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.2002.1179 DO - 10.1098/rstb.2002.1179 ID - Binder2003 ER - TY - JOUR AU - Giegè, P. AU - Sweetlove, L. J. AU - Congat, V. AU - Leaver, C. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Coordination of nuclear and mitochondrial genome expression during mitochondrial biogenesis in Arabidopsis JO - Plant Cell VL - 17 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.104.030254 DO - 10.1105/tpc.104.030254 ID - Giegè2005 ER - TY - JOUR AU - Hammani, K. AU - Gobert, A. AU - Hleibieh, K. AU - Choulier, L. AU - Small, L. AU - Giegè, P. PY - 2011 DA - 2011// TI - An Arabidopsis dual-localized pentatricopeptide repeat protein interacts with nuclear proteins involved in gene expression regulation JO - Plant Cell VL - 23 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.110.081638 DO - 10.1105/tpc.110.081638 ID - Hammani2011 ER - TY - JOUR AU - Roschzttardtz, H. AU - Fuentes, I. AU - Vásquez, M. AU - Corvalán, C. AU - León, G. AU - Gómez, I. AU - Araya, A. AU - Holuique, L. AU - Vicente-Carbajosa, J. AU - Jordana, X. PY - 2009 DA - 2009// TI - A nuclear gene encoding the iron-sulfur subunit of mitochondrial complex II is regulated by B3 domain transcription factors during seed development in Arabidopsis thaliana JO - Plant Physiol VL - 150 UR - https://doi.org/10.1104/pp.109.136531 DO - 10.1104/pp.109.136531 ID - Roschzttardtz2009 ER - TY - JOUR AU - Van Aken, O. AU - Zhang, B. AU - Law, S. AU - Narsai, R. AU - Whelan, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - AtWKRY40 and AtWRKY63 modulate the expression of stress-responsive nuclear genes encoding mitochondrial and chloroplast proteins JO - Plant Physiol VL - 162 UR - https://doi.org/10.1104/pp.113.215996 DO - 10.1104/pp.113.215996 ID - Van Aken2013 ER - TY - JOUR AU - Giraud, E. AU - Ng, S. AU - Carrie, C. AU - Duncan, O. AU - Low, J. AU - Lee, C. P. AU - Van Aken, O. AU - Millar, A. H. AU - Murcha, M. AU - Whelan, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - TCP transcription factors link the regulation of genes encoding mitochondrial proteins with the circadian clock in Arabidopsis thaliana JO - Plant Cell VL - 22 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.110.074518 DO - 10.1105/tpc.110.074518 ID - Giraud2010 ER - TY - JOUR AU - De Clercq, I. AU - Vermeirssen, V. AU - Van Aken, O. AU - Vandepoele, K. AU - Murcha, M. W. AU - Law, S. R. AU - Inzé, A. AU - Ng, S. AU - Ivanova, A. AU - Rombaut, D. AU - Van de Cotte, B. AU - Jaspers, P. AU - Van de Peer, Y. AU - Kangasjärvi, J. AU - Whelan, J. AU - Van Breusegem, F. PY - 2013 DA - 2013// TI - The membrane-bound NAC transcription factor ANAC013 functions in mitochondrial retrograde regulation of the oxidative stress response in Arabidopsis JO - Plant Cell VL - 25 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.113.117168 DO - 10.1105/tpc.113.117168 ID - De Clercq2013 ER - TY - JOUR AU - Ölçer, H. AU - Lloyd, J. C. AU - Raines, C. A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Photosynthetic capacity is differentially affected by reductions in sedoheptulose-1,7-biphosphatase activity during leaf development in transgenic tobacco plants JO - Plant Physiol VL - 125 UR - https://doi.org/10.1104/pp.125.2.982 DO - 10.1104/pp.125.2.982 ID - Ölçer2001 ER - TY - JOUR AU - Rogalski, M. AU - Schöttler, M. A. AU - Thiele, W. AU - Schulze, W. X. AU - Bock, R. PY - 2008 DA - 2008// TI - Rpl33, a nonessential plastid-encoded ribosomal protein in tobacco, is required under cold stress conditions JO - Plant Cell VL - 20 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.108.060392 DO - 10.1105/tpc.108.060392 ID - Rogalski2008 ER - TY - JOUR AU - Unseld, M. AU - Marienfeld, J. R. AU - Brandt, P. AU - Brennicke, A. PY - 1997 DA - 1997// TI - The mitochondrial genome of Arabidopsis thaliana contains 57 genes in 366,924 nucleotide JO - Nat Genet VL - 15 UR - https://doi.org/10.1038/ng0197-57 DO - 10.1038/ng0197-57 ID - Unseld1997 ER - TY - JOUR AU - Dickinson, A. AU - Yeung, K. Y. AU - Donoghue, J. AU - Baker, M. J. AU - Kelly, R. D. W. AU - McKenzie, M. AU - Jhons, T. J. AU - St John, J. C. PY - 2013 DA - 2013// TI - The regulation of mitochondrial DNA copy number in glioblastoma cells JO - Cell Death Differ VL - 20 UR - https://doi.org/10.1038/cdd.2013.115 DO - 10.1038/cdd.2013.115 ID - Dickinson2013 ER - TY - JOUR AU - Klodmann, J. AU - Senkler, M. AU - Rode, C. AU - Braun, H. P. PY - 2011 DA - 2011// TI - Defining the protein complex proteome of plant mitochondria JO - Plant Physiol VL - 157 UR - https://doi.org/10.1104/pp.111.182352 DO - 10.1104/pp.111.182352 ID - Klodmann2011 ER - TY - JOUR AU - Padimam, M. AU - Reddy, V. S. AU - Beachy, R. N. AU - Fauquet, C. M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Molecular characterization of a plant mitochondrial chaperone GrpE JO - Plant Mol Biol VL - 39 UR - https://doi.org/10.1023/A:1006143305907 DO - 10.1023/A:1006143305907 ID - Padimam1999 ER - TY - JOUR AU - Fiorani, F. AU - Umbach, A. L. AU - Siedow, J. N. PY - 2005 DA - 2005// TI - The alternative oxidase of plant mitochondria is involved in the acclimation of shoot growth at low temperature. A study of Arabidopsis AOX1a transgenic plants JO - Plant Physiol VL - 139 UR - https://doi.org/10.1104/pp.105.070789 DO - 10.1104/pp.105.070789 ID - Fiorani2005 ER - TY - JOUR AU - Smolková, K. AU - Jezek, P. PY - 2012 DA - 2012// TI - The role of mitochondrial NADPH-dependent isocitrate dehydrogenase in cancer cells JO - Int J Cell Biol VL - 212 UR - https://doi.org/10.1155/2012/273947 DO - 10.1155/2012/273947 ID - Smolková2012 ER - TY - JOUR AU - Robert, N. AU - D’Erfurth, I. AU - Marmagne, A. AU - Erhardt, M. AU - Allot, M. AU - Boivin, K. AU - Gissot, L. AU - Monachello, D. AU - Michaud, M. AU - Duchêne, A. M. AU - Barbier-Brygoo, H. AU - Maréchal-Drouard, L. AU - Ephritikhine, G. AU - Filleur, S. PY - 2012 DA - 2012// TI - Voltage-dependent-anion-channels (VDACs) in Arabidopsis have a dual localization in the cell but show a distinct role in mitochondria JO - Plant Mol Biol VL - 78 UR - https://doi.org/10.1007/s11103-012-9874-5 DO - 10.1007/s11103-012-9874-5 ID - Robert2012 ER - TY - JOUR AU - Leadsham, J. E. AU - Sanders, G. AU - Giannaki, S. AU - Bastow, E. L. AU - Hutton, R. AU - Naeimi, W. R. AU - Breitenbach, M. AU - Gourlay, C. W. PY - 2013 DA - 2013// TI - Loss of cytochrome c oxidase promotes RAS-dependent ROS production from the ER resident NADPH oxidase, Yno1p, in yeast JO - Cell Metab VL - 18 UR - https://doi.org/10.1016/j.cmet.2013.07.005 DO - 10.1016/j.cmet.2013.07.005 ID - Leadsham2013 ER - TY - JOUR AU - Smith, A. M. O. AU - Ratcliffe, G. AU - Sweetlove, L. J. PY - 2004 DA - 2004// TI - Activation and function of mitochondrial uncoupling protein in plants JO - J Biol Chem VL - 279 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M408920200 DO - 10.1074/jbc.M408920200 ID - Smith2004 ER - TY - JOUR AU - Liesa, M. AU - Shirihai, O. S. PY - 2013 DA - 2013// TI - Mitochondrial dynamics in the regulation of nutrient utilization and energy expenditure JO - Cell Metab VL - 17 UR - https://doi.org/10.1016/j.cmet.2013.03.002 DO - 10.1016/j.cmet.2013.03.002 ID - Liesa2013 ER - TY - JOUR AU - Schneider, C. A. AU - Rasband, W. S. AU - Eliceir, K. W. PY - 2012 DA - 2012// TI - NIH image to ImageJ: 25 years of image analysis JO - Nat Methods VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth.2089 DO - 10.1038/nmeth.2089 ID - Schneider2012 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Hajnóczky, G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Altered fusion dynamics underlie unique morphological changes in mitochondria during hypoxia-reoxygenation stress JO - Cell Death Differ VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/cdd.2011.13 DO - 10.1038/cdd.2011.13 ID - Liu2011 ER - TY - JOUR PY - 2013 DA - 2013// TI - Update on activities at the universal protein resource (UniProt) in 2013 JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gks1068 DO - 10.1093/nar/gks1068 ID - ref44 ER - TY - JOUR AU - Tatusov, R. L. AU - Fedorova, N. D. AU - Jackson, J. D. AU - Jacobs, A. R. AU - Kiryutin, B. AU - Koonin, E. V. AU - Krylov, D. M. AU - Mazumder, R. AU - Mekhedov, S. L. AU - Nikoslkaya, A. N. AU - Rao, B. S. AU - Smirnov, A. S. AU - Sverdlove, A. V. AU - Vasudevan, S. AU - Wolf, Y. I. AU - Yin, J. J. AU - Natale, D. A. PY - 2003 DA - 2003// TI - The COG database: an updated version includes eukaryotes JO - BMC Bioinforma VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2105-4-41 DO - 10.1186/1471-2105-4-41 ID - Tatusov2003 ER - TY - JOUR AU - Lamesch, P. AU - Berardini, T. Z. AU - Li, D. AU - Swarbreck, D. AU - Wilks, C. AU - Sasidharan, R. AU - Muller, R. AU - Dreher, K. AU - Alexander, D. L. AU - Garcia-Hernandez, M. AU - Karthikeyan, A. S. AU - Lee, C. H. AU - Nelson, W. D. AU - Ploetz, L. AU - Singh, S. AU - Wensel, A. AU - Huala, E. PY - 2012 DA - 2012// TI - The Arabidopsis information resource (TAIR): improved gene annotation and new tools JO - Nucleic Acids Res VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr1090 DO - 10.1093/nar/gkr1090 ID - Lamesch2012 ER - TY - JOUR AU - Emanuelsson, O. AU - Brunak, S. AU - Heijne, V. J. AU - Nielsen, H. PY - 2007 DA - 2007// TI - Locating proteins in the cell using TargetP, SignalP, and related tools JO - Nat Protoc VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2007.131 DO - 10.1038/nprot.2007.131 ID - Emanuelsson2007 ER - TY - JOUR AU - Oelkrug, R. AU - Kutschke, M. AU - Meyer, C. W. AU - Heldmaier, G. AU - Jastroch, M. PY - 2010 DA - 2010// TI - Uncoupling protein 1 decreases superoxide production in brown adipose tissue mitochondria JO - J Biol Chem VL - 285 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M110.122861 DO - 10.1074/jbc.M110.122861 ID - Oelkrug2010 ER - TY - JOUR AU - Vafai, S. B. AU - Mootha, V. K. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mitochondrial disorders as windows into an ancient organelle JO - Nature VL - 491 UR - https://doi.org/10.1038/nature11707 DO - 10.1038/nature11707 ID - Vafai2012 ER - TY - JOUR AU - Wu, Z. AU - Puigserver, P. AU - Andersson, U. AU - Zhang, C. AU - Adelmant, G. AU - Mootha, V. AU - Troy, A. AU - Cinti, S. AU - Lowell, B. AU - Scarpulla, R. C. AU - Spiegelman, B. M. PY - 1999 DA - 1999// TI - Mechanisms controlling mitochondrial biogenesis and respiration through the thermogenic coactivator PGC-1 JO - Cell VL - 98 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)80611-X DO - 10.1016/S0092-8674(00)80611-X ID - Wu1999 ER - TY - JOUR AU - Miyoshi, N. AU - Oubrahim, H. AU - Chock, P. B. AU - Stadtman, E. R. PY - 2006 DA - 2006// TI - Age-dependent cell death and the role of ATP in hydrogen-peroxide-induced apoptosis and necrosis JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0510346103 DO - 10.1073/pnas.0510346103 ID - Miyoshi2006 ER - TY - JOUR AU - Moghadam, A. A. AU - Ebrahimie, E. AU - Taghavi, S. M. AU - Niazi, A. AU - Babgohari, M. Z. AU - Deihimi, T. AU - Djavaheri, M. AU - Ramezani, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - How the nucleus and mitochondria communicate in energy production during stress: nuclear MtATP6, an early-stress responsive gene, regulates the mitochondrial F1F0-ATP synthase complex JO - Mol Biotechnol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1007/s12033-012-9624-6 DO - 10.1007/s12033-012-9624-6 ID - Moghadam2013 ER - TY - JOUR AU - Lin, J. AU - Wu, H. AU - Tarr, P. T. AU - Zhang, C. Y. AU - Wu, Z. AU - Boss, O. AU - Michael, L. F. AU - Puigserver, P. AU - Isotani, E. AU - Olson, E. N. AU - Lowell, B. B. AU - Bassel-Duby, R. AU - Spiegelman, B. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Transcriptional co-activator PGC-1 alpha drives the formation of slow twitch muscle fibres JO - Nature VL - 418 UR - https://doi.org/10.1038/nature00904 DO - 10.1038/nature00904 ID - Lin2002 ER - TY - JOUR AU - Peters, K. AU - Niessen, M. AU - Peterhansel, C. AU - Spath, B. AU - Holzle, A. AU - Binder, S. AU - Marchfelder, A. AU - Braun, H. P. PY - 2012 DA - 2012// TI - Complex I-complex II ratio strongly differs in various organs of Arabidopsis thaliana JO - Plant Mol Biol VL - 79 UR - https://doi.org/10.1007/s11103-012-9911-4 DO - 10.1007/s11103-012-9911-4 ID - Peters2012 ER - TY - JOUR AU - Law, S. R. AU - Narsai, R. AU - Taylor, N. L. AU - Dellanoy, E. AU - Carrie, C. AU - Giraud, E. AU - Millar, A. H. AU - Small, I. AU - Whelan, J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Nucleotide and RNA metabolism prime translational initiation in the earliest events of mitochondrial biogenesis during Arabidopsis germination JO - Plant Physiol VL - 158 UR - https://doi.org/10.1104/pp.111.192351 DO - 10.1104/pp.111.192351 ID - Law2012 ER - TY - CHAP AU - Berg, J. M. AU - Tymoczko, J. L. AU - Stryer, L. PY - 2002 DA - 2002// TI - Biochemistry BT - The Citric Acid Cycle PB - W H Freeman CY - New York ID - Berg2002 ER - TY - JOUR AU - Pfanner, N. AU - Geissler, A. PY - 2001 DA - 2001// TI - Versatility of the mitochondrial protein import machinery JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/35073006 DO - 10.1038/35073006 ID - Pfanner2001 ER - TY - JOUR AU - Schleiffe, E. AU - Becker, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Common ground for protein translocation: access control for mitochondria and chloroplasts JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 12 UR - https://doi.org/10.1038/nrm3027 DO - 10.1038/nrm3027 ID - Schleiffe2011 ER - TY - JOUR AU - Searcy, D. G. PY - 2003 DA - 2003// TI - Metabolic integration during the evolutionary origin of mitochondria JO - Cell Res VL - 13 UR - https://doi.org/10.1038/sj.cr.7290168 DO - 10.1038/sj.cr.7290168 ID - Searcy2003 ER - TY - JOUR AU - Kleine, T. AU - Leister, D. PY - 2013 DA - 2013// TI - Retrograde signals galore JO - Front Plant Sci VL - 4 UR - https://doi.org/10.3389/fpls.2013.00045 DO - 10.3389/fpls.2013.00045 ID - Kleine2013 ER - TY - JOUR AU - Stael, S. AU - Wurzinger, B. AU - Mair, A. AU - Mehlmer, N. AU - Vothknecht, U. C. AU - Teige, M. PY - 2012 DA - 2012// TI - Plant organellar calcium signaling: an emerging field JO - J Exp Bot VL - 63 UR - https://doi.org/10.1093/jxb/err394 DO - 10.1093/jxb/err394 ID - Stael2012 ER - TY - JOUR AU - Clapham, D. E. PY - 2007 DA - 2007// TI - Calcium signaling JO - Cell VL - 131 UR - https://doi.org/10.1016/j.cell.2007.11.028 DO - 10.1016/j.cell.2007.11.028 ID - Clapham2007 ER - TY - JOUR AU - Tarasov, A. I. AU - Griffiths, E. J. AU - Rutter, G. A. PY - 2012 DA - 2012// TI - Regulation of ATP production by mitochondrial Ca + 2 JO - Cell Calcium VL - 52 UR - https://doi.org/10.1016/j.ceca.2012.03.003 DO - 10.1016/j.ceca.2012.03.003 ID - Tarasov2012 ER - TY - JOUR AU - Alam, M. R. AU - Groschner, L. N. AU - Parichatikanond, W. AU - Kuo, L. AU - Bondarenko, A. I. AU - Rost, R. AU - Waldeck-Weiermaier, M. AU - Mali, R. AU - Graier, W. F. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mitochondrial Ca2+ uptake 1 (MICU1) and mitochondrial Ca + 2 uniporter (MCU) contribute to metabolism secretion coupling in clonal pancreatic β-cells JO - J Biol Chem VL - 287 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M112.392084 DO - 10.1074/jbc.M112.392084 ID - Alam2012 ER - TY - JOUR AU - Palty, R. AU - Silverman, W. F. AU - Herschfinkel, M. AU - Caporale, T. AU - Sensi, S. L. AU - Parnis, J. AU - Nolte, C. AU - Fishman, D. AU - Shoshan-Barmatz, D. AU - Herrmann, S. AU - Khananshvili, D. AU - Sekler, I. PY - 2010 DA - 2010// TI - NCLX is an essential component of mitochondrial Na+/Ca+2 exchange JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 107 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0908099107 DO - 10.1073/pnas.0908099107 ID - Palty2010 ER - TY - JOUR AU - Mailloux, R. J. AU - Harper, M. E. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mitochondrial proticity and ROS signaling: lessons from the uncoupling proteins JO - Trends Endocrinol Metab VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.tem.2012.04.004 DO - 10.1016/j.tem.2012.04.004 ID - Mailloux2012 ER - TY - JOUR AU - Si, Y. AU - Palani, S. AU - Jayaraman, A. AU - Lee, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Effects of forced uncoupling protein1 expression in 3T3-L1 cells on mitochondrial function and lipid metabolism JO - J Lipid Res VL - 48 UR - https://doi.org/10.1194/jlr.M600343-JLR200 DO - 10.1194/jlr.M600343-JLR200 ID - Si2007 ER - TY - JOUR AU - Wang, D. Y. AU - Zhang, Q. AU - Liu, Y. AU - Lin, Z. F. AU - Zhang, S. X. AU - Sun, M. X. PY - 2010 DA - 2010// TI - The levels of male gametic mitochondrial DNA are highly regulated in angiosperms with regard to mitochondrial inheritance JO - Plant Cell VL - 22 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.109.071902 DO - 10.1105/tpc.109.071902 ID - Wang2010 ER - TY - JOUR AU - Yoo, S. D. AU - Cho, Y. H. AU - Sheen, J. PY - 2007 DA - 2007// TI - Arabidopsis mesophyll protoplasts: a versatile cell system for transient gene expression analysis JO - Nat Protoc VL - 2 UR - https://doi.org/10.1038/nprot.2007.199 DO - 10.1038/nprot.2007.199 ID - Yoo2007 ER - TY - JOUR AU - Ogawa, K. AU - Hatano-Iwasaki, A. AU - Yanagida, M. AU - Iwabuchi, M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Level of glutathione is regulated by ATP-dependent ligation of glutamate and cysteine through photosynthesis in Arabidopsis thaliana: mechanism of strong interaction of light intensity with flowering JO - Plant Cell Physiol VL - 45 UR - https://doi.org/10.1093/pcp/pch008 DO - 10.1093/pcp/pch008 ID - Ogawa2004 ER - TY - JOUR AU - Keech, O. AU - Dizengremel, P. AU - Gardestrom, P. PY - 2005 DA - 2005// TI - Preparation of leaf mitochondria from Arabidopsis thaliana JO - Physiol Plant VL - 124 UR - https://doi.org/10.1111/j.1399-3054.2005.00521.x DO - 10.1111/j.1399-3054.2005.00521.x ID - Keech2005 ER - TY - JOUR AU - Grabherr, M. G. AU - Haas, B. J. AU - Yassour, M. AU - Levin, J. Z. AU - Thompson, D. A. AU - Amit, I. AU - Adiconis, X. AU - Fan, L. AU - Raychowdhury, R. AU - Zeng, Q. AU - Chen, Z. AU - Mauceli, E. AU - Hacohen, N. AU - Gnirke, A. AU - Rhind, N. AU - di Palma, F. AU - Birren, B. W. AU - Nusbaum, C. AU - Lindblad-Toh, K. AU - Friedman, N. AU - Regev, A. PY - 2011 DA - 2011// TI - Full-length transcriptome assembly from RNA-seq data without reference genome JO - Nat Biotechnol VL - 29 UR - https://doi.org/10.1038/nbt.1883 DO - 10.1038/nbt.1883 ID - Grabherr2011 ER - TY - JOUR AU - Wagner, G. P. AU - Kin, K. AU - Lynch, V. J. PY - 2012 DA - 2012// TI - Measurement of mRNA abundance using RNA-seq data: RPKM measure is inconsistent among samples JO - Theory Biosci VL - 131 UR - https://doi.org/10.1007/s12064-012-0162-3 DO - 10.1007/s12064-012-0162-3 ID - Wagner2012 ER - TY - JOUR AU - Langmead, B. AU - Trapnell, C. AU - Pop, M. AU - Salzberg, S. L. PY - 2009 DA - 2009// TI - Ultrafast and memory-efficient alignment of short DNA sequences to the human genome JO - Genome Biol VL - 10 UR - https://doi.org/10.1186/gb-2009-10-3-r25 DO - 10.1186/gb-2009-10-3-r25 ID - Langmead2009 ER - TY - JOUR PY - 2012 DA - 2012// TI - The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution JO - Nature VL - 485 UR - https://doi.org/10.1038/nature11119 DO - 10.1038/nature11119 ID - ref75 ER - TY - JOUR AU - Naika, M. AU - Shameer, K. AU - Mathew, O. K. AU - Gowda, R. AU - Sowdhamini, R. PY - 2013 DA - 2013// TI - STIFDB2: An updated version of plant stress-responsive transcription factor database with additional stress signals, stress-responsive transcription factor binding sites and stress-responsive genes in Arabidopsis and rice JO - Plant Cell Physiol VL - 54 UR - https://doi.org/10.1093/pcp/pcs185 DO - 10.1093/pcp/pcs185 ID - Naika2013 ER -