Skip to main content

Table 3 Expressional abundance of the known miRNAs calculated in Reads per Million

From: Identification of novel maize miRNAs by measuring the precision of precursor processing

Family

miRNA name

mixed tissues I

mixed tissues II

embryo

endosperm

zma-miR156

zma-miR156a, b, c, d, e, f, g, h

3416.73

3982.77

20459.65

5369.74

 

zma-miR156j

0.15

0.08

0.07

0.63

 

zma-miR156k

77.67

255.79

78.72

8.57

zma-miR159

zma-miR159a, b, f, j, k

4.98

33.31

1.15

0.1

 

zma-miR159e

-

-

-

-

 

zma-miR159h, i

-

-

-

-

 

zma-miR159g

-

-

-

-

 

zma-miR159d, c

-

-

-

-

zma-miR160

zma-miR160a, b, c, d, e, g

3.22

1.42

0.95

0.31

 

zma-miR160f

-

-

-

-

zma-miR162

zma-miR162

-

0.08

-

-

zma-miR164

zma-miR164c, b, c, d, g

118.56

425.76

77.71

2.19

 

zma-miR164e

18.17

8.85

3.71

212.18

 

zma-miR164f

1.47

6.51

1.62

0.21

 

zma-miR164h

-

-

-

-

zma-miR166

zma-miR166a

2261.6

906.37

1338.94

3871.12

 

zma-miR166b, c, d, e, f, g, h, i

35.17

21.71

48

49.75

 

zma-miR166k, n

103.03

16.86

14.58

4.29

 

zma-miR166l, m, l

227.16

61.36

29.57

6.27

zma-miR167

zma-miR167a, b, c, d

1179.31

379.09

1541.27

7358.55

 

zma-miR167e, f, g, h, j, i

159.74

143.59

83.98

319.62

zma-miR168

zma-miR168a, b

19080.41

1012.31

1578.81

33060.87

zma-miR169

zma-miR169a, b

2.93

9.02

0.34

0.1

 

zma-miR169c, r

4.54

3.09

0.81

-

 

zma-miR169d

-

-

-

-

 

zma-miR169e

-

-

-

-

 

zma-miR169f, g, h

-

-

-

-

 

zma-miR169o

-

0.25

0.54

0.1

 

zma-miR169l

-

-

-

-

 

zma-miR169p

9.82

3.59

-

-

 

zma-miR169q, m, n

-

-

-

-

 

zma-miR169i, j, k

2.93

1

-

-

zma-miR171

zma-miR171a

-

-

-

-

 

zma-miR171b

-

0.08

-

-

 

zma-miR171c

-

-

-

-

 

zma-miR171d, e, i, j

11.28

21.29

6.55

26.23

 

zma-miR171f

-

-

-

-

 

zma-miR171g

-

-

-

-

 

zma-miR171l, m

-

-

-

-

 

zma-miR171n

-

-

-

-

 

zma-miR171k, h

-

-

-

0.1

zma-miR172

zma-miR172a, b, c, d

1.32

5.43

0.07

-

 

zma-miR172e

6.45

7.26

0.47

-

zma-miR2118

zma-miR2118a

-

0.17

-

-

 

zma-miR2118b

0.15

0.17

0.07

0.1

 

zma-miR2118c

-

-

-

-

 

zma-miR2118d

-

0.17

-

-

 

zma-miR2118e

-

-

-

-

 

zma-miR2118f

-

-

-

-

 

zma-miR2118g

0.29

0.33

-

-

zma-miR2275

zma-miR2275a-3p

-

3.26

-

-

 

zma-miR2275a-5p

0.29

0.58

-

-

 

zma-miR2275b-5p

0.15

1.17

-

-

 

zma-miR2275c, b-3p

0.44

1.42

-

-

 

zma-miR2275c-5p

-

-

-

-

 

zma-miR2275d-3p

-

-

-

-

 

zma-miR2275d-5p

-

-

-

-

zma-miR319

zma-miR319a, b, c, d

1.03

0.33

2.5

-

zma-miR390

zma-miR390a

49.53

7.43

8.1

0.94

zma-miR393

zma-miR393a, c

-

-

-

-

 

zma-miR393b

-

-

-

-

zma-miR394

zma-miR394a, b

23.59

2.84

4.12

-

zma-miR395

zma-miR395a, b.d, e, f, g, h, I, n,

-

-

-

-

 

zma-miR395k

-

-

-

-

 

zma-miR395o

-

-

-

-

 

zma-miR395l, m

-

-

-

-

zma-miR396

zma-miR396a, b

2.34

0.75

1.35

3.97

 

zma-miR396c, d

-

-

-

-

 

zma-miR396e, f

-

0.33

-

-

 

zma-miR396g.h

-

0.33

-

-

zma-miR397

zma-miR397a, b

0.15

0.17

0.07

-

zma-miR398

zma-miR398a, b

10.41

0.5

0.47

1.67

zma-miR399

zma-miR399a, c, h

0.73

0.17

-

-

 

zma-miR399b

-

0.08

-

-

 

zma-miR399d

-

0.08

-

-

 

zma-miR399e, j, i

0.59

-

0.07

-

 

zma-miR399f

-

-

0.07

-

 

zma-miR399g

-

-

-

-

zma-miR408

zma-miR408a, b

-

-

-

-

zma-miR482

zma-miR482

-

-

-

-

zma-miR528

zma-miR528a, b

2195.36

1625.23

978.17

583.22

zma-miR529

zma-miR529

19.78

64.03

5.06

-

zma-miR827

zma-miR827

313.62

272.32

558.31

528.77

zma-miR1432

zma-miR1433

-

-

-

-