Candidate gene | Site position1 | %Var | P-value | Means of SNP alleles2 (accession classes) | |
---|---|---|---|---|---|
BLZ1 | Flowering time [days after sowing] | ||||
 | 1733 | 6.46 | 0.0033 | A: 67.96 | C: 69.87 |
 | 1825 | 7.38 | 0.0031 | G: 67.96 | A: 69.91 |
 | 1888 | 6.46 | 0.0033 | C: 67.96 | T: 69.87 |
 | 1890 | 7.10 | 0.0017 | G: 67.50 | A: 69.54 |
 | 2038 | 7.52 | 0.0011 | Del: 67.62 | AT: 69.68 |
 | 2520 | 7.10 | 0.0017 | G: 67.50 | A: 69.54 |
 | 2562 | 6.46 | 0.0033 | C: 67.96 | T: 69.87 |
 | 2774 | 7.10 | 0.0017 | T: 67.50 | C: 69.54 |
BPBF | Crude protein content [%] | ||||
 | -368 | 6.65 | 0.0003 | G: 14.85 | A: 15.63 |
 | -315 | 5.40 | 0.0003 | T: 14.85 | C: 15.63 |
 | -303 | 6.50 | 0.0003 | T: 14.87 | A: 15.63 |
 | -215 | 6.86 | 0.0002 | C: 14.86 | G: 15.63 |
 | -209 | 6.19 | 0.0004 | A: 14.88 | G: 15.63 |
 | -166 | 6.07 | 0.0003 | A: 14.87 | G: 15.64 |
 | -101 | 5.38 | 0.0004 | T: 14.88 | C: 15.64 |
 | -27 | 4.94 | 0.0003 | C: 14.88 | T: 15.65 |
 | -3 | 6.76 | 0.0002 | T: 14.82 | C: 15.64 |
 | 62 | 4.02 | <.0001 | T: 14.79 | C: 15.66 |
 | 579 | 12.40 | 0.0003 | T: 14.90 | C: 15.66 |
 | 586 | 3.34 | 0.0025 | G: 14.93 | A: 15.58 |
 | 618 | 3.42 | 0.0019 | A: 14.91 | G: 15.58 |
 | 713 | 5.45 | 0.0008 | A: 14.88 | G: 15.60 |
 | 797 | 4.06 | 0.0029 | G: 14.94 | T: 15.58 |
 | 972 | 4.40 | 0.0016 | G: 14.91 | A: 15.59 |
 | 1026 | 7.91 | 0.0019 | T: 14.98 | G: 15.62 |
 | 1075 | 3.51 | 0.0007 | A: 14.91 | G: 15.63 |
 | 1129 | 5.57 | 0.0007 | C: 14.92 | A: 15.63 |
 | Starch content [%] | ||||
 | -368 | 4.44 | 0.0004 | A: 55.58 | G: 56.74 |
 | -315 | 7.30 | 0.0007 | C: 55.57 | T: 56.66 |
 | -303 | 5.39 | 0.0002 | A: 55.56 | T: 56.77 |
 | -215 | 4.41 | 0.0004 | G: 55.58 | C: 56.73 |
 | -209 | 4.84 | 0.0003 | G: 55.57 | A: 56.74 |
 | -166 | 5.12 | 0.0001 | G: 55.55 | A: 56.78 |
 | -101 | 4.79 | 0.0001 | C: 55.53 | T: 56.78 |
 | -27 | 4.22 | 0.0001 | T: 55.55 | C: 56.79 |
 | -3 | 3.27 | 0.0008 | C: 55.61 | T: 56.72 |
 | 62 | 0.16 | 0.0009 | C: 55.56 | T. 56.70 |