TY - JOUR AU - van Loon, L. C. AU - Rep, M. AU - Pieterse, C. M. J. PY - 2006 DA - 2006// TI - Significance of inducible defense-related proteins in infected plants JO - Annu Rev Phytopathol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1146/annurev.phyto.44.070505.143425 DO - 10.1146/annurev.phyto.44.070505.143425 ID - van Loon2006 ER - TY - JOUR AU - Christensen, A. B. AU - Cho, B. H. AU - Naesby, M. AU - Gregersen, P. L. AU - Brandt, J. AU - Madriz-Ordeñana, K. AU - Collinge, D. B. AU - Thordal-Christensen, H. PY - 2002 DA - 2002// TI - The molecular characterization of two barley proteins establishes the novel PR-17 family of pathogenesis-related proteins JO - Mol Plant Pathol VL - 3 UR - https://doi.org/10.1046/j.1364-3703.2002.00105.x DO - 10.1046/j.1364-3703.2002.00105.x ID - Christensen2002 ER - TY - JOUR AU - Radauer, C. AU - Lackner, P. AU - Breiteneder, H. PY - 2008 DA - 2008// TI - The Bet v I fold: an ancient, versatile scaffold for binding of large, hydrophobic ligands JO - BMC Evol Biol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2148-8-286 DO - 10.1186/1471-2148-8-286 ID - Radauer2008 ER - TY - JOUR AU - Wen, J. AU - Vanek-Krebitz, M. AU - Hoffmann-Sommergruber, K. AU - Scheiner, O. AU - Breiteneder, H. PY - 1997 DA - 1997// TI - The potential of Betv1 homologues, a nuclear multigene family as phylogenetic markers in flowering plants JO - Mol Phylogenet Evol VL - 8 UR - https://doi.org/10.1006/mpev.1997.0447 DO - 10.1006/mpev.1997.0447 ID - Wen1997 ER - TY - JOUR AU - Finkler, C. AU - Giacomet, C. AU - Muschner, V. C. AU - Salzano, F. M. AU - Freitas, L. B. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular investigations of pathogenesis-related Bet v 1 homologues in Passiflora (Passifloraceae) JO - Genetica VL - 124 UR - https://doi.org/10.1007/s10709-004-6369-6 DO - 10.1007/s10709-004-6369-6 ID - Finkler2005 ER - TY - JOUR AU - Schenk, M. F. AU - Cordewener, J. H. G. AU - America, A. H. P. AU - van't Westende, W. P. C. AU - Smulders, M. J. M. AU - Gilissen, L. J. W. J. PY - 2009 DA - 2009// TI - Characterization of PR-10 genes from eight Betula species and detection of Bet v I isoforms in birch pollen JO - BMC Plant Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2229-9-24 DO - 10.1186/1471-2229-9-24 ID - Schenk2009 ER - TY - JOUR AU - Gao, Z. S. AU - van de Weg, W. E. AU - Schaart, J. G. AU - Schouten, H. J. AU - Tran, D. H. AU - Kodde, L. P. AU - van de Meer, I. M. AU - van der Geest, A. H. M. AU - Kodde, J. AU - Breiteneder, H. AU - Hoffmann-Sommergruber, K. AU - Bosch, D. AU - Gilissen, L. J. W. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - Genomic cloning and linkage mapping of the Mal d 1 (PR-10) gene family in apple (Malus domestica) JO - Theor Appl Genet VL - 111 UR - https://doi.org/10.1007/s00122-005-2018-4 DO - 10.1007/s00122-005-2018-4 ID - Gao2005 ER - TY - JOUR AU - Chen, L. AU - Zhang, S. AU - Illa, E. AU - Song, L. AU - Wu, S. AU - Howard, W. AU - Arús, P. AU - van de Weg, E. AU - Chen, K. AU - Gao, Z. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genomic characterization of putative allergen genes in peach/almond and their synteny with apple JO - BMC Genom VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-543 DO - 10.1186/1471-2164-9-543 ID - Chen2008 ER - TY - JOUR AU - Liu, J. J. AU - Ekramoddoullah, A. K. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - The family 10 of plant pathogenesis-related proteins: Their structure, regulation, and function in response to biotic and abiotic stresses JO - Physiol Mol Plant Pathol VL - 68 UR - https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2006.06.004 DO - 10.1016/j.pmpp.2006.06.004 ID - Liu2006 ER - TY - JOUR AU - Koistinen, K. M. AU - Soininen, P. AU - Vanäläinen, T. A. AU - Häyrinen, J. AU - Laatikainen, R. AU - Peräkylä, M. AU - Tervahauta, A. I. AU - Kärenlampi, S. O. PY - 2005 DA - 2005// TI - Birch PR-10c interacts with several biologically important ligands JO - Phytochem VL - 66 UR - https://doi.org/10.1016/j.phytochem.2005.09.007 DO - 10.1016/j.phytochem.2005.09.007 ID - Koistinen2005 ER - TY - JOUR AU - Handschuh, L. AU - Femiak, I. AU - Kasperska, A. AU - Figlerowicz, M. AU - Sikorski, M. M. PY - 2007 DA - 2007// TI - Structural and functional characteristics of two novel members of pathogenesis-related multigene family of class 10 from yellow lupine JO - Acta Bioch Pol VL - 54 ID - Handschuh2007 ER - TY - JOUR AU - Neudecker, P. AU - Schweimer, K. AU - Nerkamp, J. AU - Scheurer, S. AU - Vieths, S. AU - Sticht, H. AU - Rösch, P. PY - 2001 DA - 2001// TI - Allergic cross-reactivity made visible: solution structure of the major cherry allergen Pru av 1 JO - J Biol Chem VL - 276 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M101657200 DO - 10.1074/jbc.M101657200 ID - Neudecker2001 ER - TY - JOUR AU - Biesiadka, J. AU - Bujacz, G. AU - Sikorski, M. M. AU - Jaskolski, M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Crystal structures of two homologous pathogenesis-related proteins from yellow lupine JO - J Mol Biol VL - 319 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(02)00385-6 DO - 10.1016/S0022-2836(02)00385-6 ID - Biesiadka2002 ER - TY - JOUR AU - Marković-Housley, Z. AU - Degano, M. AU - Lamba, D. AU - von Roepenack-Lahaye, E. AU - Clemens, S. AU - Susani, M. AU - Ferreira, F. AU - Scheiner, O. AU - Breiteneder, H. PY - 2003 DA - 2003// TI - Crystal structure of a hypoallergenic isoform of the major birch pollen allergen Bet v 1 and its likely biological function as a plant steroid carrier JO - J Mol Biol VL - 325 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-2836(02)01197-X DO - 10.1016/S0022-2836(02)01197-X ID - Marković-Housley2003 ER - TY - JOUR AU - Schirmer, T. AU - Hoffmann-Sommergruber, K. AU - Susani, M. AU - Breiteneder, M. AU - Marković-Housley, Z. PY - 2005 DA - 2005// TI - Crystal structure of the major celery allergen Api g 1: Molecular analysis of cross-reactivity JO - J Mol Biol VL - 351 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2005.06.054 DO - 10.1016/j.jmb.2005.06.054 ID - Schirmer2005 ER - TY - JOUR AU - Mogensen, J. E. AU - Wimmer, R. AU - Larsen, J. N. AU - Spangfort, M. D. AU - Otzen, D. E. PY - 2002 DA - 2002// TI - The major birch allergen, Bet v 1, shows affinity for a broad spectrum of physiological ligands JO - J Biol Chem VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M202065200 DO - 10.1074/jbc.M202065200 ID - Mogensen2002 ER - TY - JOUR AU - Fernandes, H. AU - Pasternak, O. AU - Bujacz, G. AU - Bujacz, A. AU - Sikorski, M. M. AU - Jaskolski, M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Lupinus luteus pathogenesis-related protein as a reservoir for cytokinin JO - J Mol Biol VL - 378 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmb.2008.03.027 DO - 10.1016/j.jmb.2008.03.027 ID - Fernandes2008 ER - TY - JOUR AU - Robert, N. AU - Ferran, J. AU - Breda, C. AU - Coutos-Thévenot, P. AU - Boulay, M. AU - Buffard, D. AU - Esnault, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Molecular characterization of the incompatible interaction of Vitis vinifera leaves with Pseudomonas syringae pv. pisi: Expression of genes coding for stilbene synthase and class 10 PR protein JO - Eur J Plant Pathol VL - 107 UR - https://doi.org/10.1023/A:1011241001383 DO - 10.1023/A:1011241001383 ID - Robert2001 ER - TY - JOUR AU - Maillot, P. AU - Lebel, S. AU - Schellenbaum, P. AU - Jacques, A. AU - Walter, B. PY - 2009 DA - 2009// TI - Differential regulation of SERK, LEC1-Like and Pathogenesis-Related genes during indirect secondary somatic embryogenesis in grapevine JO - Plant Physiol Biochem VL - 47 UR - https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2009.03.016 DO - 10.1016/j.plaphy.2009.03.016 ID - Maillot2009 ER - TY - JOUR AU - Jellouli, N. AU - Ben Jouira, H. AU - Skouri, H. AU - Ghorbel, A. AU - Gourgouri, A. AU - Mliki, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Proteomic analysis of Tunisian grapevine cultivar Razegui under salt stress JO - J Plant Physiol VL - 165 UR - https://doi.org/10.1016/j.jplph.2007.02.009 DO - 10.1016/j.jplph.2007.02.009 ID - Jellouli2008 ER - TY - JOUR AU - Castro, A. J. AU - Carapito, C. AU - Zorn, N. AU - Magné, C. AU - Leize, E. AU - Van Dorsselaer, A. AU - Clément, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - Proteomic analysis of grapevine (Vitis vinifera L.) tissues subjected to herbicide stress JO - J Exp Bot VL - 56 UR - https://doi.org/10.1093/jxb/eri271 DO - 10.1093/jxb/eri271 ID - Castro2005 ER - TY - JOUR AU - Fung, R. W. M. AU - Gonzalo, M. AU - Fekete, C. AU - Kovacs, L. G. AU - He, Y. AU - Marsh, E. AU - McIntyre, L. M. AU - Schachtman, D. P. AU - Qiu, W. PY - 2008 DA - 2008// TI - Powdery mildew induces defense-oriented reprogramming of the transcriptome in a susceptible but not in a resistant grapevine JO - Plant Physiol VL - 146 UR - https://doi.org/10.1104/pp.107.108712 DO - 10.1104/pp.107.108712 ID - Fung2008 ER - TY - JOUR AU - Polesani, M. AU - Desario, F. AU - Ferrarini, A. AU - Zamboni, A. AU - Pezzotti, M. AU - Kortekamp, A. AU - Polverari, A. PY - 2008 DA - 2008// TI - cDNA-AFLP analysis of plant and pathogen genes expressed in grapevine infected with Plasmopara viticola JO - BMC Genom VL - 9 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-9-142 DO - 10.1186/1471-2164-9-142 ID - Polesani2008 ER - TY - JOUR AU - Jaillon, O. AU - Aury, J. M. AU - Noel, B. AU - Policriti, A. AU - Clepet, C. AU - Casagrande, A. AU - Choisne, N. AU - Aubourg, S. AU - Vitulo, N. AU - Jubin, C. AU - Vezzi, A. AU - Legeai, F. AU - Hugueney, P. AU - Dasilva, C. AU - Horner, D. AU - Mica, E. AU - Jublot, D. AU - Poulain, J. AU - Bruyere, C. AU - Billault, A. AU - Segurens, B. AU - Gouyvenoux, M. AU - Ugarte, E. AU - Cattonaro, F. AU - Anthouard, V. AU - Vico, V. AU - Del Fabbro, C. AU - Alaux, M. AU - Di Gaspero, G. AU - Dumas, V. AU - Felice, N. AU - Paillard, S. AU - Juman, I. AU - Moroldo, M. AU - Scalabrin, S. AU - Canaguier, A. AU - Le Clainche, I. AU - Malacrida, G. AU - Durand, E. AU - Pesole, G. AU - Laucou, V. AU - Chatelet, P. AU - Merdinoglu, D. AU - Delledonne, M. AU - Pezzotti, M. AU - Lecharny, A. AU - Scarpelli, C. AU - Artiguenave, F. AU - Pe, M. E. AU - Valle, G. AU - Morgante, M. AU - Caboche, M. AU - Adam-Blondon, A. F. AU - Weissenbach, J. AU - Quetier, F. AU - Wincker, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla JO - Nature VL - 449 UR - https://doi.org/10.1038/nature06148 DO - 10.1038/nature06148 ID - Jaillon2007 ER - TY - JOUR AU - Velasco, R. AU - Zharkikh, A. AU - Troggio, M. AU - Cartwright, D. A. AU - Cestaro, A. AU - Pruss, D. AU - Pindo, M. AU - FitzGerald, L. M. AU - Vezzulli, S. AU - Reid, J. AU - Malacarne, G. AU - Iliev, D. AU - Coppola, G. AU - Wardel, B. AU - Micheletti, D. AU - Macalma, T. AU - Facci, M. AU - Mitchell, J. T. AU - Perazzolli, M. AU - Eldredge, G. AU - Gatto, P. AU - Oyzersky, R. AU - Moretto, M. AU - Gutin, N. AU - Stefanini, M. AU - Chen, Y. AU - Segala, C. AU - Davenport, C. AU - Demattè, L. AU - Mraz, A. AU - Battilana, J. AU - Stormo, K. AU - Costa, F. AU - Tao, Q. AU - Si-Ammour, A. AU - Harkins, T. AU - Lackey, A. AU - Perbost, C. AU - Taillon, B. AU - Stella, A. AU - Solovyev, V. AU - Fawcett, J. A. AU - Sterck, L. AU - Vandepoele, K. AU - Grando, S. M. AU - Toppo, S. AU - Moser, C. AU - Lanchbury, J. AU - Bogden, R. AU - Skolnick, M. AU - Sgaramella, V. AU - Bhatnagar, S. K. AU - Fontana, P. AU - Gutin, A. AU - Van de Peer, Y. AU - Salamini, F. AU - Viola, R. PY - 2007 DA - 2007// TI - A high quality draft consensus sequence of the genome of a heterozygous grapevine variety JO - PLoS ONE VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0001326 DO - 10.1371/journal.pone.0001326 ID - Velasco2007 ER - TY - JOUR AU - Schenk, M. F. AU - Gilissen, L. J. W. J. AU - Esselink, G. D. AU - Smulders, M. J. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Seven different genes encode a diverse mixture of isoforms of Bet v I, the major birch pollen allergen JO - BMC Genom VL - 7 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2164-7-168 DO - 10.1186/1471-2164-7-168 ID - Schenk2006 ER - TY - STD TI - Tewari S, Brown SM, Kenyon P, Balcerzak M, Fristensky B: Plant defense multigene families: II evolution of coding sequence and differential expression of PR10 genes in Pisum. arXiv.org/q-bio.PE/0310038 ID - ref27 ER - TY - JOUR AU - Musidlowska-Persson, A. AU - Alm, R. AU - Emanuelsson, C. PY - 2007 DA - 2007// TI - Cloning and sequencing of the Bet v 1-homologous allergen Fra a 1 in strawberry (Fragaria ananassa) shows the presence of an intron and little variability in amino acid sequence JO - Mol Immunol VL - 44 UR - https://doi.org/10.1016/j.molimm.2006.06.004 DO - 10.1016/j.molimm.2006.06.004 ID - Musidlowska-Persson2007 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Huang, B. AU - Lin, J. AU - Fei, J. AU - Chen, Z. AU - Pang, Y. AU - Sun, X. AU - Tang, K. PY - 2006 DA - 2006// TI - A novel pathogenesis-related protein (SsPR10) from Solanum surattense with ribonucleolytic and antimicrobial activity is stress- and pathogen-inducible JO - J Plant Physiol VL - 163 UR - https://doi.org/10.1016/j.jplph.2005.04.031 DO - 10.1016/j.jplph.2005.04.031 ID - Liu2006 ER - TY - JOUR AU - Kim, S. T. AU - Yu, S. AU - Kang, Y. H. AU - Kim, S. G. AU - Kim, J. Y. AU - Kim, S. H. AU - Kang, K. Y. PY - 2008 DA - 2008// TI - The rice pathogen-related protein 10 (JIOsPR10) is induced by abiotic and biotic stresses and exhibits ribonuclease activity JO - Plant Cell Rep VL - 27 UR - https://doi.org/10.1007/s00299-007-0485-6 DO - 10.1007/s00299-007-0485-6 ID - Kim2008 ER - TY - JOUR AU - Rizzon, C. AU - Ponger, L. AU - Gaut, B. S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Striking similarities in the genomic distribution of tandemly arrayed genes in Arabidopsis and rice JO - PLoS Comput Biol VL - 2 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.0020115 DO - 10.1371/journal.pcbi.0020115 ID - Rizzon2006 ER - TY - JOUR AU - Flagel, L. E. AU - Wendel, J. F. PY - 2009 DA - 2009// TI - Gene duplication and evolutionary novelty in plants JO - New Phytol VL - 183 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2009.02923.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2009.02923.x ID - Flagel2009 ER - TY - JOUR AU - Tang, H. AU - Wang, X. AU - Bowers, J. E. AU - Ming, R. AU - Alam, M. AU - Paterson, A. H. PY - 2008 DA - 2008// TI - Unraveling ancient hexaploidy through multiply-aligned angiosperm gene maps JO - Genome Res VL - 18 UR - https://doi.org/10.1101/gr.080978.108 DO - 10.1101/gr.080978.108 ID - Tang2008 ER - TY - JOUR AU - Thomas, B. C. AU - Pedersen, B. AU - Freeling, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - Following tetraploidy in an Arabidopsis ancestor, genes were removed preferentially from one homeolog leaving clusters enriched in dose-sensitive genes JO - Genome Res VL - 16 UR - https://doi.org/10.1101/gr.4708406 DO - 10.1101/gr.4708406 ID - Thomas2006 ER - TY - JOUR AU - Bachem, C. W. B. AU - van der Hoeven, R. S. AU - de Bruijn, S. M. AU - Vreugdenhil, D. AU - Zabeau, M. AU - Visser, R. G. F. PY - 1996 DA - 1996// TI - Visualization of differential gene expression using a novel method of RNA fingerprinting based on AFLP: Analysis of gene expression during potato tuber development JO - Plant J VL - 9 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-313X.1996.9050745.x DO - 10.1046/j.1365-313X.1996.9050745.x ID - Bachem1996 ER - TY - JOUR AU - Cronn, R. C. AU - Adams, K. L. PY - 2003 DA - 2003// TI - Quantitative analysis of transcript accumulation from genes duplicated by polyploidy using cDNA-SSCP JO - Biotechniques VL - 34 ID - Cronn2003 ER - TY - JOUR AU - Federico, M. L. AU - Iñiguez-Luy, F. L. AU - Skadsen, R. W. AU - Kaeppler, H. F. PY - 2006 DA - 2006// TI - Spatial and temporal divergence of expression in duplicated barley germin-like protein-encoding genes JO - Genetics VL - 174 UR - https://doi.org/10.1534/genetics.106.058156 DO - 10.1534/genetics.106.058156 ID - Federico2006 ER - TY - JOUR AU - Fehér, A. AU - Pasternak, T. P. AU - Dudits, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - Transition of somatic plant cells to an embryogenic state JO - Plant Cell Tissue Organ Cult VL - 74 UR - https://doi.org/10.1023/A:1024033216561 DO - 10.1023/A:1024033216561 ID - Fehér2003 ER - TY - JOUR AU - Marsoni, M. AU - Bracale, M. AU - Espen, L. AU - Prinsi, B. AU - Negri, A. S. AU - Vannini, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - Proteomic analysis of somatic embryogenesis in Vitis vinifera JO - Plant Cell Rep VL - 27 UR - https://doi.org/10.1007/s00299-007-0438-0 DO - 10.1007/s00299-007-0438-0 ID - Marsoni2008 ER - TY - JOUR AU - Srivastava, S. AU - Emery, R. J. N. AU - Kurepin, L. V. AU - Reid, D. M. AU - Fristensky, B. AU - Kav, N. N. V. PY - 2006 DA - 2006// TI - Pea PR 10.1 is a ribonuclease and its transgenic expression elevates cytokinin levels JO - Plant Growth Regul VL - 49 UR - https://doi.org/10.1007/s10725-006-0022-6 DO - 10.1007/s10725-006-0022-6 ID - Srivastava2006 ER - TY - STD TI - The Genoscope grape genome browser. [http://www.genoscope.cns.fr/externe/GenomeBrowser/Vitis/] UR - http://www.genoscope.cns.fr/externe/GenomeBrowser/Vitis/ ID - ref41 ER - TY - STD TI - The Genoscope web Blat tool. [http://www.genoscope.cns.fr/blat-server/cgi-bin/vitis/webBlat] UR - http://www.genoscope.cns.fr/blat-server/cgi-bin/vitis/webBlat ID - ref42 ER - TY - STD TI - The European Bioinformatics Institute Clustal W online tool. [http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/] UR - http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/ ID - ref43 ER - TY - STD TI - The National Center for Biotechnology Information Blast tool. [http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi] UR - http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi ID - ref44 ER - TY - STD TI - The University of London bioinformatics web server. [http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php] UR - http://mendel.cs.rhul.ac.uk/mendel.php ID - ref45 ER - TY - STD TI - The European Bioinformatics Institute Transeq program. [http://www.ebi.ac.uk/Tools/emboss/transeq/] UR - http://www.ebi.ac.uk/Tools/emboss/transeq/ ID - ref46 ER - TY - STD TI - The ExPASy Compute pI/Mw tool. [http://www.expasy.ch/tools/pi_tool.html] UR - http://www.expasy.ch/tools/pi_tool.html ID - ref47 ER - TY - STD TI - The ExPASy Prosite database. [http://www.expasy.ch/prosite] UR - http://www.expasy.ch/prosite ID - ref48 ER - TY - STD TI - The ExPASy Swiss-model server. [http://swissmodel.expasy.org/] UR - http://swissmodel.expasy.org/ ID - ref49 ER - TY - JOUR AU - Galtier, N. AU - Gouy, M. AU - Gautier, C. PY - 1996 DA - 1996// TI - SEAVIEW and PHYLO_WIN: two graphic tools for sequence alignment and molecular phylogeny JO - Comput Appl Biosci VL - 12 ID - Galtier1996 ER - TY - JOUR AU - Maillot, P. AU - Kieffer, F. AU - Walter, B. PY - 2006 DA - 2006// TI - Somatic embryogenesis from stem nodal sections of grapevine JO - Vitis VL - 45 ID - Maillot2006 ER -