Repeat motif | NV#20F1-30 | NV#20F1-39 | F6 | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Tetra | Penta | ≥ Hexa | Tetra | Penta | ≥ Hexa | Tetra | Penta | ≥ Hexa | |
AC/GT | - | - | 20 | - | - | 13 | - | - | 23 |
AG/CT | - | - | 15 | - | - | 5 | - | - | 60 |
AT/AT | - | - | 22 | - | - | 22 | - | - | 4 |
CG/CG | - | - | 1 | - | - | 1 | - | - | 5 |
AAC/GTT | 16 | 1 | 16 | 10 | 1 | ||||
AAG/CTT | 26 | 6 | 3 | 13 | 2 | 1 | 43 | 17 | 6 |
AAT/ATT | 19 | 6 | 2 | 8 | 1 | ||||
ACC/GGT | 14 | 3 | 4 | 43 | 10 | 9 | |||
ACG/CGT | 13 | 2 | 1 | 7 | 1 | 51 | 7 | 1 | |
ACT/AGT | 13 | 3 | 1 | 1 | 1 | 7 | 2 | ||
AGC/GCT | 36 | 6 | 1 | 15 | 3 | 4 | 57 | 19 | 9 |
AGG/CCT | 11 | 1 | 3 | 114 | 14 | 11 | |||
ATC/GAT | 33 | 18 | 5 | 14 | 7 | 19 | 5 | 1 | |
CCG/CGG | 5 | 2 | 302 | 86 | 61 | ||||
AAAG/CTTT | 4 | 1 | 1 | ||||||
AAGG/CCTT | 2 | 1 | 6 | ||||||
AATG/CATT | 5 | 5 | 2 | ||||||
ACGC/GCGT | 1 | ||||||||
ACGG/CCGT | |||||||||
ACGT/ACGT | 1 | ||||||||
ACTC/GAGT | 5 | 4 | 6 | ||||||
AGAT/ATCT | 18 | 4 | 5 | ||||||
AGCC/GGCT | 5 | ||||||||
AGCG/CGCT | 1 | 1 | |||||||
AGCT/AGCT | 1 | 4 | |||||||
AGGG/CCCT | 6 | ||||||||
AGGT/ACCT | |||||||||
CCCG/CGGG | 2 | ||||||||
CCGG/CCGG | 1 | 1 | |||||||
CATC/GATG | 2 | 1 | |||||||
CTGC/GCAG | 1 | ||||||||
GATC/GATC | 7 | 1 | 1 | 2 | |||||
GCAT/ATGC | 1 | ||||||||
AACC/GGTT | 1 | 1 | |||||||
AGTG/CACT | 1 | ||||||||
ATAC/GTAT | 2 | 1 | |||||||
CCGA/TCGG | 2 | 3 | |||||||
GATG/CATC | |||||||||
TATC/GATA | 1 | ||||||||
TGTA/TACA | 1 | 3 | 1 | ||||||
AAGAG/CTCTT | 1 | ||||||||
TCCCA/TCCCA | 1 | ||||||||
TCGTC/GACGA | 3 | ||||||||
AGAGG/CCTCT | 1 | 2 | |||||||
ATCGC/GCGAT | 1 | ||||||||
CCGCT/AGCGG | 1 | ||||||||
GCGAG/CTCGC | 1 | ||||||||
TGTCG/CGACA | 3 | ||||||||
CATGG/CCATG | 1 | ||||||||
GATCT/AGATC | 1 | ||||||||
GTGTT/AACAC | 1 | ||||||||
TGTGG/CCACA | 1 | ||||||||
AGAACA/TGTTCT | |||||||||
ACCTCC/GGAGGT | 1 | ||||||||
ACTCCT/AGGAGT | 2 | ||||||||
AGAGGC/GCCTCT | 1 | ||||||||
AGAGGG/CCCTCT | 1 | ||||||||
AGAGGT/ACCTCT | 1 | ||||||||
AGCTCC/GGAGCT | 1 | ||||||||
GAAGAG/CTCTTC | 1 | 1 |